Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0C8

Vav3, Guanine nucleotide exchange factor VAV3, mousemouse

Predictions only

Length 847 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vav3Q9R0C8 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Vav3Q9R0C8 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Vav3Q9R0C8 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Vav3Q9R0C8 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Vav3Q9R0C8 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Vav3Q9R0C8 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Vav3Q9R0C8 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Vav3Q9R0C8 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Vav3Q9R0C8 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Vav3Q9R0C8 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Vav3Q9R0C8 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Vav3Q9R0C8 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Vav3Q9R0C8 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.5
Vav3Q9R0C8 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Vav3Q9R0C8 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Vav3Q9R0C8 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Vav3Q9R0C8 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Vav3Q9R0C8 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Vav3Q9R0C8 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Vav3Q9R0C8 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Vav3Q9R0C8 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Vav3Q9R0C8 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Vav3Q9R0C8 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Vav3Q9R0C8 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Vav3Q9R0C8 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Vav3Q9R0C8 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Vav3Q9R0C8 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Vav3Q9R0C8 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Vav3Q9R0C8 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Vav3Q9R0C8 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Vav3Q9R0C8 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Vav3Q9R0C8 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Vav3Q9R0C8 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Vav3Q9R0C8 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Vav3Q9R0C8 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Vav3Q9R0C8 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Vav3Q9R0C8 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Vav3Q9R0C8 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Vav3Q9R0C8 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Vav3Q9R0C8 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Vav3Q9R0C8 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Vav3Q9R0C8 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Vav3Q9R0C8 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Vav3Q9R0C8 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Vav3Q9R0C8 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Vav3Q9R0C8 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Vav3Q9R0C8 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Vav3Q9R0C8 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Vav3Q9R0C8 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Vav3Q9R0C8 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Vav3Q9R0C8 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Vav3Q9R0C8 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Vav3Q9R0C8 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Vav3Q9R0C8 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Vav3Q9R0C8 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Vav3Q9R0C8 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Vav3Q9R0C8 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Vav3Q9R0C8 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Vav3Q9R0C8 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Vav3Q9R0C8 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Vav3Q9R0C8 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Vav3Q9R0C8 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Vav3Q9R0C8 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Vav3Q9R0C8 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Vav3Q9R0C8 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Vav3Q9R0C8 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Vav3Q9R0C8 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Vav3Q9R0C8 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Vav3Q9R0C8 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Vav3Q9R0C8 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Vav3Q9R0C8 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Vav3Q9R0C8 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Vav3Q9R0C8 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Vav3Q9R0C8 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Vav3Q9R0C8 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Vav3Q9R0C8 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Vav3Q9R0C8 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Vav3Q9R0C8 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Vav3Q9R0C8 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Vav3Q9R0C8 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Vav3Q9R0C8 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Vav3Q9R0C8 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Vav3Q9R0C8 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Vav3Q9R0C8 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Vav3Q9R0C8 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Vav3Q9R0C8 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Vav3Q9R0C8 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Vav3Q9R0C8 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Vav3Q9R0C8 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Vav3Q9R0C8 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Vav3Q9R0C8 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Vav3Q9R0C8 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Vav3Q9R0C8 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Vav3Q9R0C8 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Vav3Q9R0C8 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Vav3Q9R0C8 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Vav3Q9R0C8 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Vav3Q9R0C8 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Vav3Q9R0C8 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Vav3Q9R0C8 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.1 ms