Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0A5

Nek3, Serine/threonine-protein kinase Nek3, mousemouse

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Length 511 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nek3Q9R0A5 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Nek3Q9R0A5 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Nek3Q9R0A5 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Nek3Q9R0A5 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Nek3Q9R0A5 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Nek3Q9R0A5 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Nek3Q9R0A5 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Nek3Q9R0A5 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Nek3Q9R0A5 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Nek3Q9R0A5 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Nek3Q9R0A5 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Nek3Q9R0A5 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Nek3Q9R0A5 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Nek3Q9R0A5 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Nek3Q9R0A5 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Nek3Q9R0A5 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Nek3Q9R0A5 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Nek3Q9R0A5 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Nek3Q9R0A5 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Nek3Q9R0A5 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Nek3Q9R0A5 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Nek3Q9R0A5 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Nek3Q9R0A5 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Nek3Q9R0A5 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Nek3Q9R0A5 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Nek3Q9R0A5 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Nek3Q9R0A5 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Nek3Q9R0A5 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Nek3Q9R0A5 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Nek3Q9R0A5 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Nek3Q9R0A5 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Nek3Q9R0A5 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Nek3Q9R0A5 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Nek3Q9R0A5 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Nek3Q9R0A5 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Nek3Q9R0A5 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Nek3Q9R0A5 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Nek3Q9R0A5 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Nek3Q9R0A5 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Nek3Q9R0A5 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Nek3Q9R0A5 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Nek3Q9R0A5 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Nek3Q9R0A5 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Nek3Q9R0A5 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Nek3Q9R0A5 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Nek3Q9R0A5 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Nek3Q9R0A5 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Nek3Q9R0A5 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Nek3Q9R0A5 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Nek3Q9R0A5 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
Nek3Q9R0A5 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Nek3Q9R0A5 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Nek3Q9R0A5 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Nek3Q9R0A5 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Nek3Q9R0A5 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Nek3Q9R0A5 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Nek3Q9R0A5 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Nek3Q9R0A5 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Nek3Q9R0A5 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Nek3Q9R0A5 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Nek3Q9R0A5 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Nek3Q9R0A5 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Nek3Q9R0A5 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Nek3Q9R0A5 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Nek3Q9R0A5 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Nek3Q9R0A5 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Nek3Q9R0A5 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Nek3Q9R0A5 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Nek3Q9R0A5 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Nek3Q9R0A5 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Nek3Q9R0A5 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Nek3Q9R0A5 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Nek3Q9R0A5 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Nek3Q9R0A5 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Nek3Q9R0A5 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Nek3Q9R0A5 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Nek3Q9R0A5 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Nek3Q9R0A5 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Nek3Q9R0A5 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Nek3Q9R0A5 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Nek3Q9R0A5 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Nek3Q9R0A5 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Nek3Q9R0A5 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Nek3Q9R0A5 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Nek3Q9R0A5 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Nek3Q9R0A5 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Nek3Q9R0A5 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Nek3Q9R0A5 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Nek3Q9R0A5 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Nek3Q9R0A5 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Nek3Q9R0A5 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Nek3Q9R0A5 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Nek3Q9R0A5 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Nek3Q9R0A5 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Nek3Q9R0A5 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Nek3Q9R0A5 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Nek3Q9R0A5 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Nek3Q9R0A5 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Nek3Q9R0A5 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Nek3Q9R0A5 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.3 ms