Protein–RNA interactions for Protein: Q9R049

Amfr, E3 ubiquitin-protein ligase AMFR, mousemouse

Predictions only

Length 643 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AmfrQ9R049 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.53
AmfrQ9R049 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
AmfrQ9R049 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
AmfrQ9R049 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
AmfrQ9R049 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
AmfrQ9R049 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
AmfrQ9R049 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
AmfrQ9R049 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
AmfrQ9R049 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
AmfrQ9R049 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
AmfrQ9R049 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
AmfrQ9R049 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
AmfrQ9R049 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
AmfrQ9R049 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
AmfrQ9R049 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
AmfrQ9R049 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
AmfrQ9R049 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
AmfrQ9R049 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
AmfrQ9R049 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
AmfrQ9R049 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
AmfrQ9R049 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
AmfrQ9R049 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
AmfrQ9R049 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
AmfrQ9R049 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
AmfrQ9R049 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
AmfrQ9R049 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
AmfrQ9R049 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
AmfrQ9R049 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
AmfrQ9R049 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
AmfrQ9R049 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
AmfrQ9R049 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
AmfrQ9R049 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
AmfrQ9R049 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
AmfrQ9R049 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
AmfrQ9R049 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
AmfrQ9R049 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
AmfrQ9R049 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
AmfrQ9R049 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
AmfrQ9R049 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
AmfrQ9R049 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
AmfrQ9R049 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
AmfrQ9R049 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
AmfrQ9R049 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
AmfrQ9R049 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
AmfrQ9R049 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
AmfrQ9R049 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
AmfrQ9R049 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
AmfrQ9R049 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
AmfrQ9R049 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
AmfrQ9R049 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
AmfrQ9R049 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
AmfrQ9R049 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
AmfrQ9R049 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
AmfrQ9R049 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC18.37■□□□□ 0.53
AmfrQ9R049 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
AmfrQ9R049 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
AmfrQ9R049 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
AmfrQ9R049 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
AmfrQ9R049 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
AmfrQ9R049 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
AmfrQ9R049 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
AmfrQ9R049 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
AmfrQ9R049 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
AmfrQ9R049 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
AmfrQ9R049 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
AmfrQ9R049 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
AmfrQ9R049 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
AmfrQ9R049 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
AmfrQ9R049 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
AmfrQ9R049 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
AmfrQ9R049 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
AmfrQ9R049 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
AmfrQ9R049 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
AmfrQ9R049 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
AmfrQ9R049 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
AmfrQ9R049 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
AmfrQ9R049 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
AmfrQ9R049 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
AmfrQ9R049 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
AmfrQ9R049 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
AmfrQ9R049 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
AmfrQ9R049 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
AmfrQ9R049 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
AmfrQ9R049 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
AmfrQ9R049 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
AmfrQ9R049 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
AmfrQ9R049 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
AmfrQ9R049 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
AmfrQ9R049 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
AmfrQ9R049 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
AmfrQ9R049 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
AmfrQ9R049 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC18.35■□□□□ 0.53
AmfrQ9R049 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
AmfrQ9R049 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
AmfrQ9R049 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
AmfrQ9R049 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
AmfrQ9R049 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
AmfrQ9R049 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
AmfrQ9R049 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
AmfrQ9R049 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.9 ms