Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZD4

Ercc4, DNA repair endonuclease XPF, mousemouse

Predictions only

Length 917 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ercc4Q9QZD4 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ercc4Q9QZD4 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ercc4Q9QZD4 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ercc4Q9QZD4 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ercc4Q9QZD4 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ercc4Q9QZD4 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Ercc4Q9QZD4 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Ercc4Q9QZD4 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Ercc4Q9QZD4 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Ercc4Q9QZD4 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Ercc4Q9QZD4 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ercc4Q9QZD4 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ercc4Q9QZD4 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ercc4Q9QZD4 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Ercc4Q9QZD4 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ercc4Q9QZD4 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Ercc4Q9QZD4 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ercc4Q9QZD4 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ercc4Q9QZD4 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ercc4Q9QZD4 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ercc4Q9QZD4 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ercc4Q9QZD4 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ercc4Q9QZD4 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ercc4Q9QZD4 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ercc4Q9QZD4 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ercc4Q9QZD4 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ercc4Q9QZD4 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ercc4Q9QZD4 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ercc4Q9QZD4 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ercc4Q9QZD4 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ercc4Q9QZD4 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ercc4Q9QZD4 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ercc4Q9QZD4 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Ercc4Q9QZD4 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ercc4Q9QZD4 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ercc4Q9QZD4 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ercc4Q9QZD4 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ercc4Q9QZD4 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ercc4Q9QZD4 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ercc4Q9QZD4 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ercc4Q9QZD4 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ercc4Q9QZD4 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ercc4Q9QZD4 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ercc4Q9QZD4 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Ercc4Q9QZD4 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ercc4Q9QZD4 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Ercc4Q9QZD4 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ercc4Q9QZD4 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ercc4Q9QZD4 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ercc4Q9QZD4 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ercc4Q9QZD4 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ercc4Q9QZD4 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ercc4Q9QZD4 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ercc4Q9QZD4 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ercc4Q9QZD4 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ercc4Q9QZD4 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ercc4Q9QZD4 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ercc4Q9QZD4 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ercc4Q9QZD4 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ercc4Q9QZD4 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ercc4Q9QZD4 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ercc4Q9QZD4 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ercc4Q9QZD4 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ercc4Q9QZD4 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ercc4Q9QZD4 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ercc4Q9QZD4 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ercc4Q9QZD4 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ercc4Q9QZD4 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ercc4Q9QZD4 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ercc4Q9QZD4 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ercc4Q9QZD4 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ercc4Q9QZD4 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ercc4Q9QZD4 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ercc4Q9QZD4 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ercc4Q9QZD4 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ercc4Q9QZD4 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ercc4Q9QZD4 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ercc4Q9QZD4 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ercc4Q9QZD4 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ercc4Q9QZD4 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ercc4Q9QZD4 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ercc4Q9QZD4 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ercc4Q9QZD4 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Ercc4Q9QZD4 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ercc4Q9QZD4 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ercc4Q9QZD4 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ercc4Q9QZD4 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ercc4Q9QZD4 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ercc4Q9QZD4 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ercc4Q9QZD4 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ercc4Q9QZD4 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ercc4Q9QZD4 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ercc4Q9QZD4 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ercc4Q9QZD4 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ercc4Q9QZD4 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ercc4Q9QZD4 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ercc4Q9QZD4 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Ercc4Q9QZD4 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ercc4Q9QZD4 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ercc4Q9QZD4 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.2 ms