Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZ15

Clec4a, C-type lectin domain family 4 member A, mousemouse

Predictions only

Length 238 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clec4aQ9QZ15 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Clec4aQ9QZ15 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Clec4aQ9QZ15 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Clec4aQ9QZ15 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Clec4aQ9QZ15 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Clec4aQ9QZ15 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Clec4aQ9QZ15 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Clec4aQ9QZ15 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Clec4aQ9QZ15 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Clec4aQ9QZ15 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Clec4aQ9QZ15 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Clec4aQ9QZ15 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Clec4aQ9QZ15 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Clec4aQ9QZ15 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Clec4aQ9QZ15 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Clec4aQ9QZ15 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Clec4aQ9QZ15 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Clec4aQ9QZ15 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Clec4aQ9QZ15 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Clec4aQ9QZ15 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Clec4aQ9QZ15 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Clec4aQ9QZ15 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Clec4aQ9QZ15 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Clec4aQ9QZ15 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Clec4aQ9QZ15 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Clec4aQ9QZ15 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Clec4aQ9QZ15 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Clec4aQ9QZ15 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Clec4aQ9QZ15 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Clec4aQ9QZ15 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Clec4aQ9QZ15 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Clec4aQ9QZ15 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Clec4aQ9QZ15 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Clec4aQ9QZ15 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Clec4aQ9QZ15 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Clec4aQ9QZ15 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Clec4aQ9QZ15 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Clec4aQ9QZ15 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Clec4aQ9QZ15 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Clec4aQ9QZ15 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Clec4aQ9QZ15 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Clec4aQ9QZ15 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Clec4aQ9QZ15 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Clec4aQ9QZ15 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Clec4aQ9QZ15 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Clec4aQ9QZ15 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Clec4aQ9QZ15 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Clec4aQ9QZ15 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Clec4aQ9QZ15 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Clec4aQ9QZ15 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Clec4aQ9QZ15 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Clec4aQ9QZ15 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Clec4aQ9QZ15 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Clec4aQ9QZ15 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Clec4aQ9QZ15 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Clec4aQ9QZ15 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Clec4aQ9QZ15 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Clec4aQ9QZ15 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Clec4aQ9QZ15 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Clec4aQ9QZ15 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Clec4aQ9QZ15 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Clec4aQ9QZ15 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Clec4aQ9QZ15 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Clec4aQ9QZ15 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Clec4aQ9QZ15 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Clec4aQ9QZ15 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Clec4aQ9QZ15 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Clec4aQ9QZ15 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Clec4aQ9QZ15 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Clec4aQ9QZ15 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Clec4aQ9QZ15 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Clec4aQ9QZ15 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Clec4aQ9QZ15 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Clec4aQ9QZ15 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Clec4aQ9QZ15 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Clec4aQ9QZ15 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Clec4aQ9QZ15 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Clec4aQ9QZ15 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Clec4aQ9QZ15 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Clec4aQ9QZ15 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Clec4aQ9QZ15 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Clec4aQ9QZ15 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Clec4aQ9QZ15 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Clec4aQ9QZ15 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Clec4aQ9QZ15 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Clec4aQ9QZ15 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Clec4aQ9QZ15 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Clec4aQ9QZ15 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Clec4aQ9QZ15 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Clec4aQ9QZ15 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Clec4aQ9QZ15 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Clec4aQ9QZ15 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Clec4aQ9QZ15 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Clec4aQ9QZ15 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Clec4aQ9QZ15 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Clec4aQ9QZ15 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Clec4aQ9QZ15 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Clec4aQ9QZ15 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Clec4aQ9QZ15 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Clec4aQ9QZ15 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.7 ms