Protein–RNA interactions for Protein: Q9QYL7

Abt1, Activator of basal transcription 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 269 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Abt1Q9QYL7 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Abt1Q9QYL7 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Abt1Q9QYL7 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Abt1Q9QYL7 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Abt1Q9QYL7 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Abt1Q9QYL7 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Abt1Q9QYL7 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Abt1Q9QYL7 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Abt1Q9QYL7 Top3b-201ENSMUST00000023465 3073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Abt1Q9QYL7 Mcidas-201ENSMUST00000092089 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Abt1Q9QYL7 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Abt1Q9QYL7 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Abt1Q9QYL7 Derl1-201ENSMUST00000022993 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Abt1Q9QYL7 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Abt1Q9QYL7 Ss18l1-201ENSMUST00000041126 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Abt1Q9QYL7 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Abt1Q9QYL7 Spock1-203ENSMUST00000185905 2794 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Abt1Q9QYL7 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Abt1Q9QYL7 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Abt1Q9QYL7 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Abt1Q9QYL7 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Abt1Q9QYL7 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Abt1Q9QYL7 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Abt1Q9QYL7 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Abt1Q9QYL7 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Abt1Q9QYL7 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Abt1Q9QYL7 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Abt1Q9QYL7 Tarsl2-201ENSMUST00000032728 3192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Abt1Q9QYL7 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Abt1Q9QYL7 Eif4g1-204ENSMUST00000115460 5638 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Abt1Q9QYL7 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Abt1Q9QYL7 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Abt1Q9QYL7 Vsig10-202ENSMUST00000111967 4236 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Abt1Q9QYL7 Zfp553-202ENSMUST00000106312 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Abt1Q9QYL7 Dzip3-201ENSMUST00000114516 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Abt1Q9QYL7 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Abt1Q9QYL7 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Abt1Q9QYL7 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Abt1Q9QYL7 Usp33-202ENSMUST00000117492 3886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Abt1Q9QYL7 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Abt1Q9QYL7 Tomm6os-201ENSMUST00000155812 2944 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Abt1Q9QYL7 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Abt1Q9QYL7 Npnt-206ENSMUST00000117811 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Abt1Q9QYL7 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Abt1Q9QYL7 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Abt1Q9QYL7 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Abt1Q9QYL7 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Abt1Q9QYL7 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Abt1Q9QYL7 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Abt1Q9QYL7 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Abt1Q9QYL7 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Abt1Q9QYL7 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Abt1Q9QYL7 Pam-201ENSMUST00000058762 4095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Abt1Q9QYL7 Rlf-201ENSMUST00000056635 6242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Abt1Q9QYL7 Pum2-202ENSMUST00000111122 6311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Abt1Q9QYL7 Syde2-204ENSMUST00000212479 3810 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Abt1Q9QYL7 Plch2-212ENSMUST00000186598 2119 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Abt1Q9QYL7 Kdm7a-201ENSMUST00000002305 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Abt1Q9QYL7 Cadm2-203ENSMUST00000120898 2768 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Abt1Q9QYL7 Cage1-202ENSMUST00000089840 3449 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Abt1Q9QYL7 Gm12522-201ENSMUST00000142833 2439 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Abt1Q9QYL7 Dkk1-201ENSMUST00000025803 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Abt1Q9QYL7 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Abt1Q9QYL7 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Abt1Q9QYL7 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Abt1Q9QYL7 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Abt1Q9QYL7 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Abt1Q9QYL7 Etl4-208ENSMUST00000114614 5898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Abt1Q9QYL7 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Abt1Q9QYL7 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Abt1Q9QYL7 Rgl1-203ENSMUST00000111859 5092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Abt1Q9QYL7 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Abt1Q9QYL7 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Abt1Q9QYL7 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Abt1Q9QYL7 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Abt1Q9QYL7 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Abt1Q9QYL7 Chtop-206ENSMUST00000107344 2972 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Abt1Q9QYL7 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Abt1Q9QYL7 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Abt1Q9QYL7 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Abt1Q9QYL7 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Abt1Q9QYL7 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Abt1Q9QYL7 Lman2l-204ENSMUST00000125304 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Abt1Q9QYL7 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Abt1Q9QYL7 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Abt1Q9QYL7 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Abt1Q9QYL7 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Abt1Q9QYL7 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Abt1Q9QYL7 Atg9a-208ENSMUST00000189702 4110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Abt1Q9QYL7 Zfp184-202ENSMUST00000102978 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Abt1Q9QYL7 Bag6-202ENSMUST00000166426 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Abt1Q9QYL7 Six4-201ENSMUST00000043208 6402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Abt1Q9QYL7 Lin54-201ENSMUST00000046154 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Abt1Q9QYL7 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Abt1Q9QYL7 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Abt1Q9QYL7 Gm45546-201ENSMUST00000211053 2394 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Abt1Q9QYL7 Pnma1-201ENSMUST00000061425 2359 ntAPPRIS P1 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Abt1Q9QYL7 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Abt1Q9QYL7 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Abt1Q9QYL7 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.3 ms