Protein–RNA interactions for Protein: Q9QYA2

Tomm40, Mitochondrial import receptor subunit TOM40 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 361 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tomm40Q9QYA2 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Tomm40Q9QYA2 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Tomm40Q9QYA2 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Tomm40Q9QYA2 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Tomm40Q9QYA2 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Tomm40Q9QYA2 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Tomm40Q9QYA2 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Tomm40Q9QYA2 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Tomm40Q9QYA2 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Tomm40Q9QYA2 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Tomm40Q9QYA2 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Tomm40Q9QYA2 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Tomm40Q9QYA2 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Tomm40Q9QYA2 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Tomm40Q9QYA2 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Tomm40Q9QYA2 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Tomm40Q9QYA2 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Tomm40Q9QYA2 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Tomm40Q9QYA2 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Tomm40Q9QYA2 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Tomm40Q9QYA2 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Tomm40Q9QYA2 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Tomm40Q9QYA2 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Tomm40Q9QYA2 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Tomm40Q9QYA2 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Tomm40Q9QYA2 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Tomm40Q9QYA2 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Tomm40Q9QYA2 Sybu-201ENSMUST00000090057 3230 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Tomm40Q9QYA2 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Tomm40Q9QYA2 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Tomm40Q9QYA2 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Tomm40Q9QYA2 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Tomm40Q9QYA2 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Tomm40Q9QYA2 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Tomm40Q9QYA2 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Tomm40Q9QYA2 Gm45470-202ENSMUST00000210817 2192 ntTSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Tomm40Q9QYA2 Nabp1-205ENSMUST00000186684 2677 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Tomm40Q9QYA2 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Tomm40Q9QYA2 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Tomm40Q9QYA2 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Tomm40Q9QYA2 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Tomm40Q9QYA2 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Tomm40Q9QYA2 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Tomm40Q9QYA2 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Tomm40Q9QYA2 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Tomm40Q9QYA2 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Tomm40Q9QYA2 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
Tomm40Q9QYA2 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Tomm40Q9QYA2 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Tomm40Q9QYA2 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Tomm40Q9QYA2 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Tomm40Q9QYA2 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Tomm40Q9QYA2 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Tomm40Q9QYA2 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Tomm40Q9QYA2 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Tomm40Q9QYA2 Ablim2-205ENSMUST00000114205 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Tomm40Q9QYA2 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Tomm40Q9QYA2 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Tomm40Q9QYA2 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
Tomm40Q9QYA2 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Tomm40Q9QYA2 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Tomm40Q9QYA2 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Tomm40Q9QYA2 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Tomm40Q9QYA2 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Tomm40Q9QYA2 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Tomm40Q9QYA2 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Tomm40Q9QYA2 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Tomm40Q9QYA2 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Tomm40Q9QYA2 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Tomm40Q9QYA2 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
Tomm40Q9QYA2 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
Tomm40Q9QYA2 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Tomm40Q9QYA2 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
Tomm40Q9QYA2 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Tomm40Q9QYA2 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
Tomm40Q9QYA2 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Tomm40Q9QYA2 Sgk1-202ENSMUST00000092673 2576 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Tomm40Q9QYA2 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Tomm40Q9QYA2 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Tomm40Q9QYA2 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Tomm40Q9QYA2 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Tomm40Q9QYA2 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Tomm40Q9QYA2 Gm11190-201ENSMUST00000132487 3414 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Tomm40Q9QYA2 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Tomm40Q9QYA2 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Tomm40Q9QYA2 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Tomm40Q9QYA2 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Tomm40Q9QYA2 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Tomm40Q9QYA2 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Tomm40Q9QYA2 Camsap1-202ENSMUST00000114167 7981 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Tomm40Q9QYA2 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Tomm40Q9QYA2 Camsap1-201ENSMUST00000091268 7978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Tomm40Q9QYA2 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Tomm40Q9QYA2 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Tomm40Q9QYA2 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Tomm40Q9QYA2 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Tomm40Q9QYA2 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Tomm40Q9QYA2 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Tomm40Q9QYA2 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Tomm40Q9QYA2 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.5 ms