Protein–RNA interactions for Protein: Q9QY53

Nphp1, Nephrocystin-1, mousemouse

Predictions only

Length 687 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nphp1Q9QY53 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Nphp1Q9QY53 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Nphp1Q9QY53 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
Nphp1Q9QY53 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Nphp1Q9QY53 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Nphp1Q9QY53 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Nphp1Q9QY53 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Nphp1Q9QY53 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Nphp1Q9QY53 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Nphp1Q9QY53 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Nphp1Q9QY53 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Nphp1Q9QY53 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Nphp1Q9QY53 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Nphp1Q9QY53 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
Nphp1Q9QY53 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Nphp1Q9QY53 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Nphp1Q9QY53 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Nphp1Q9QY53 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Nphp1Q9QY53 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Nphp1Q9QY53 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Nphp1Q9QY53 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Nphp1Q9QY53 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Nphp1Q9QY53 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Nphp1Q9QY53 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Nphp1Q9QY53 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Nphp1Q9QY53 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Nphp1Q9QY53 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Nphp1Q9QY53 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Nphp1Q9QY53 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Nphp1Q9QY53 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Nphp1Q9QY53 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Nphp1Q9QY53 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Nphp1Q9QY53 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Nphp1Q9QY53 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Nphp1Q9QY53 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Nphp1Q9QY53 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Nphp1Q9QY53 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Nphp1Q9QY53 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Nphp1Q9QY53 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Nphp1Q9QY53 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Nphp1Q9QY53 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Nphp1Q9QY53 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Nphp1Q9QY53 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Nphp1Q9QY53 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Nphp1Q9QY53 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Nphp1Q9QY53 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Nphp1Q9QY53 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Nphp1Q9QY53 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Nphp1Q9QY53 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Nphp1Q9QY53 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Nphp1Q9QY53 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Nphp1Q9QY53 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Nphp1Q9QY53 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Nphp1Q9QY53 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Nphp1Q9QY53 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Nphp1Q9QY53 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Nphp1Q9QY53 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Nphp1Q9QY53 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Nphp1Q9QY53 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Nphp1Q9QY53 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Nphp1Q9QY53 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Nphp1Q9QY53 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Nphp1Q9QY53 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Nphp1Q9QY53 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Nphp1Q9QY53 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Nphp1Q9QY53 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Nphp1Q9QY53 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Nphp1Q9QY53 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Nphp1Q9QY53 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Nphp1Q9QY53 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Nphp1Q9QY53 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Nphp1Q9QY53 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Nphp1Q9QY53 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Nphp1Q9QY53 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Nphp1Q9QY53 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Nphp1Q9QY53 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Nphp1Q9QY53 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Nphp1Q9QY53 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Nphp1Q9QY53 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Nphp1Q9QY53 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Nphp1Q9QY53 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Nphp1Q9QY53 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Nphp1Q9QY53 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Nphp1Q9QY53 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Nphp1Q9QY53 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Nphp1Q9QY53 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Nphp1Q9QY53 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Nphp1Q9QY53 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Nphp1Q9QY53 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Nphp1Q9QY53 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Nphp1Q9QY53 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Nphp1Q9QY53 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Nphp1Q9QY53 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Nphp1Q9QY53 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Nphp1Q9QY53 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Nphp1Q9QY53 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Nphp1Q9QY53 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Nphp1Q9QY53 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Nphp1Q9QY53 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Nphp1Q9QY53 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.1 ms