Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXZ7

Nr2e3, Photoreceptor-specific nuclear receptor, mousemouse

Predictions only

Length 395 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nr2e3Q9QXZ7 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Nr2e3Q9QXZ7 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Nr2e3Q9QXZ7 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Nr2e3Q9QXZ7 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Nr2e3Q9QXZ7 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Nr2e3Q9QXZ7 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Nr2e3Q9QXZ7 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Nr2e3Q9QXZ7 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Nr2e3Q9QXZ7 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Nr2e3Q9QXZ7 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Nr2e3Q9QXZ7 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Nr2e3Q9QXZ7 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Nr2e3Q9QXZ7 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Nr2e3Q9QXZ7 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Nr2e3Q9QXZ7 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Nr2e3Q9QXZ7 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Nr2e3Q9QXZ7 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Nr2e3Q9QXZ7 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Nr2e3Q9QXZ7 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Nr2e3Q9QXZ7 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Nr2e3Q9QXZ7 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Nr2e3Q9QXZ7 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Nr2e3Q9QXZ7 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Nr2e3Q9QXZ7 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Nr2e3Q9QXZ7 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Nr2e3Q9QXZ7 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Nr2e3Q9QXZ7 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Nr2e3Q9QXZ7 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Nr2e3Q9QXZ7 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Nr2e3Q9QXZ7 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Nr2e3Q9QXZ7 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Nr2e3Q9QXZ7 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Nr2e3Q9QXZ7 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Nr2e3Q9QXZ7 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Nr2e3Q9QXZ7 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Nr2e3Q9QXZ7 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Nr2e3Q9QXZ7 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Nr2e3Q9QXZ7 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Nr2e3Q9QXZ7 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Nr2e3Q9QXZ7 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Nr2e3Q9QXZ7 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Nr2e3Q9QXZ7 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Nr2e3Q9QXZ7 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Nr2e3Q9QXZ7 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Nr2e3Q9QXZ7 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Nr2e3Q9QXZ7 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Nr2e3Q9QXZ7 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Nr2e3Q9QXZ7 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Nr2e3Q9QXZ7 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Nr2e3Q9QXZ7 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Nr2e3Q9QXZ7 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Nr2e3Q9QXZ7 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Nr2e3Q9QXZ7 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Nr2e3Q9QXZ7 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Nr2e3Q9QXZ7 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Nr2e3Q9QXZ7 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Nr2e3Q9QXZ7 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Nr2e3Q9QXZ7 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Nr2e3Q9QXZ7 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Nr2e3Q9QXZ7 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Nr2e3Q9QXZ7 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Nr2e3Q9QXZ7 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Nr2e3Q9QXZ7 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Nr2e3Q9QXZ7 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Nr2e3Q9QXZ7 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Nr2e3Q9QXZ7 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Nr2e3Q9QXZ7 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Nr2e3Q9QXZ7 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Nr2e3Q9QXZ7 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Nr2e3Q9QXZ7 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Nr2e3Q9QXZ7 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Nr2e3Q9QXZ7 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Nr2e3Q9QXZ7 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Nr2e3Q9QXZ7 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Nr2e3Q9QXZ7 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Nr2e3Q9QXZ7 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Nr2e3Q9QXZ7 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Nr2e3Q9QXZ7 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Nr2e3Q9QXZ7 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Nr2e3Q9QXZ7 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Nr2e3Q9QXZ7 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Nr2e3Q9QXZ7 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Nr2e3Q9QXZ7 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Nr2e3Q9QXZ7 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Nr2e3Q9QXZ7 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Nr2e3Q9QXZ7 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Nr2e3Q9QXZ7 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Nr2e3Q9QXZ7 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Nr2e3Q9QXZ7 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Nr2e3Q9QXZ7 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Nr2e3Q9QXZ7 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Nr2e3Q9QXZ7 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Nr2e3Q9QXZ7 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Nr2e3Q9QXZ7 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Nr2e3Q9QXZ7 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Nr2e3Q9QXZ7 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Nr2e3Q9QXZ7 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Nr2e3Q9QXZ7 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Nr2e3Q9QXZ7 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Nr2e3Q9QXZ7 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.8 ms