Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXX8

Nufip1, Nuclear fragile X mental retardation-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 484 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nufip1Q9QXX8 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Nufip1Q9QXX8 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Nufip1Q9QXX8 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Nufip1Q9QXX8 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Nufip1Q9QXX8 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Nufip1Q9QXX8 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Nufip1Q9QXX8 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Nufip1Q9QXX8 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Nufip1Q9QXX8 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Nufip1Q9QXX8 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Nufip1Q9QXX8 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Nufip1Q9QXX8 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Nufip1Q9QXX8 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Nufip1Q9QXX8 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Nufip1Q9QXX8 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Nufip1Q9QXX8 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Nufip1Q9QXX8 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Nufip1Q9QXX8 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Nufip1Q9QXX8 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Nufip1Q9QXX8 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Nufip1Q9QXX8 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Nufip1Q9QXX8 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Nufip1Q9QXX8 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Nufip1Q9QXX8 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Nufip1Q9QXX8 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Nufip1Q9QXX8 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Nufip1Q9QXX8 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Nufip1Q9QXX8 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Nufip1Q9QXX8 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Nufip1Q9QXX8 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Nufip1Q9QXX8 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Nufip1Q9QXX8 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Nufip1Q9QXX8 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Nufip1Q9QXX8 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Nufip1Q9QXX8 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Nufip1Q9QXX8 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Nufip1Q9QXX8 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Nufip1Q9QXX8 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Nufip1Q9QXX8 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Nufip1Q9QXX8 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Nufip1Q9QXX8 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Nufip1Q9QXX8 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Nufip1Q9QXX8 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Nufip1Q9QXX8 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Nufip1Q9QXX8 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Nufip1Q9QXX8 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Nufip1Q9QXX8 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Nufip1Q9QXX8 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Nufip1Q9QXX8 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Nufip1Q9QXX8 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Nufip1Q9QXX8 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Nufip1Q9QXX8 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Nufip1Q9QXX8 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Nufip1Q9QXX8 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Nufip1Q9QXX8 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Nufip1Q9QXX8 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Nufip1Q9QXX8 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Nufip1Q9QXX8 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Nufip1Q9QXX8 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Nufip1Q9QXX8 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Nufip1Q9QXX8 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Nufip1Q9QXX8 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Nufip1Q9QXX8 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Nufip1Q9QXX8 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Nufip1Q9QXX8 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Nufip1Q9QXX8 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Nufip1Q9QXX8 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Nufip1Q9QXX8 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Nufip1Q9QXX8 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Nufip1Q9QXX8 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Nufip1Q9QXX8 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Nufip1Q9QXX8 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Nufip1Q9QXX8 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Nufip1Q9QXX8 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Nufip1Q9QXX8 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Nufip1Q9QXX8 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Nufip1Q9QXX8 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nufip1Q9QXX8 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nufip1Q9QXX8 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nufip1Q9QXX8 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nufip1Q9QXX8 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nufip1Q9QXX8 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nufip1Q9QXX8 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nufip1Q9QXX8 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nufip1Q9QXX8 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nufip1Q9QXX8 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nufip1Q9QXX8 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nufip1Q9QXX8 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Nufip1Q9QXX8 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nufip1Q9QXX8 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nufip1Q9QXX8 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nufip1Q9QXX8 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nufip1Q9QXX8 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nufip1Q9QXX8 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nufip1Q9QXX8 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nufip1Q9QXX8 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nufip1Q9QXX8 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nufip1Q9QXX8 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nufip1Q9QXX8 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nufip1Q9QXX8 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.1 ms