Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXD8

Limd1, LIM domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 668 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Limd1Q9QXD8 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Limd1Q9QXD8 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Limd1Q9QXD8 Apopt1-201ENSMUST00000040519 1065 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Limd1Q9QXD8 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Limd1Q9QXD8 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Limd1Q9QXD8 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Limd1Q9QXD8 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Limd1Q9QXD8 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Limd1Q9QXD8 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Limd1Q9QXD8 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Limd1Q9QXD8 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Limd1Q9QXD8 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Limd1Q9QXD8 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Limd1Q9QXD8 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Limd1Q9QXD8 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Limd1Q9QXD8 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Limd1Q9QXD8 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Limd1Q9QXD8 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Limd1Q9QXD8 5830454E08Rik-202ENSMUST00000213974 744 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Limd1Q9QXD8 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Limd1Q9QXD8 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Limd1Q9QXD8 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Limd1Q9QXD8 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Limd1Q9QXD8 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Limd1Q9QXD8 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Limd1Q9QXD8 Grk3-203ENSMUST00000197776 1570 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Limd1Q9QXD8 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Limd1Q9QXD8 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Limd1Q9QXD8 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Limd1Q9QXD8 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Limd1Q9QXD8 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Limd1Q9QXD8 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Limd1Q9QXD8 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Limd1Q9QXD8 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Limd1Q9QXD8 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Limd1Q9QXD8 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Limd1Q9QXD8 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Limd1Q9QXD8 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Limd1Q9QXD8 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Limd1Q9QXD8 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Limd1Q9QXD8 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Limd1Q9QXD8 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Limd1Q9QXD8 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Limd1Q9QXD8 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Limd1Q9QXD8 Ccdc24-201ENSMUST00000106422 1365 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Limd1Q9QXD8 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Limd1Q9QXD8 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Limd1Q9QXD8 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Limd1Q9QXD8 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Limd1Q9QXD8 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Limd1Q9QXD8 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Limd1Q9QXD8 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Limd1Q9QXD8 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Limd1Q9QXD8 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Limd1Q9QXD8 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Limd1Q9QXD8 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Limd1Q9QXD8 Gm1401-201ENSMUST00000122048 772 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Limd1Q9QXD8 Rps27l-203ENSMUST00000127896 575 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Limd1Q9QXD8 Gm38948-201ENSMUST00000210035 688 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Limd1Q9QXD8 Zfp810-203ENSMUST00000215202 822 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Limd1Q9QXD8 Mrpl17-201ENSMUST00000033170 1028 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Limd1Q9QXD8 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Limd1Q9QXD8 Mtus2-201ENSMUST00000071878 1211 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Limd1Q9QXD8 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Limd1Q9QXD8 Ythdf2-201ENSMUST00000085181 955 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Limd1Q9QXD8 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Limd1Q9QXD8 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Limd1Q9QXD8 Flot1-209ENSMUST00000174080 1383 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Limd1Q9QXD8 Dtd1-201ENSMUST00000028917 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Limd1Q9QXD8 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Limd1Q9QXD8 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Limd1Q9QXD8 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Limd1Q9QXD8 4930528D03Rik-201ENSMUST00000181528 1339 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Limd1Q9QXD8 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Limd1Q9QXD8 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Limd1Q9QXD8 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Limd1Q9QXD8 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Limd1Q9QXD8 Cd164l2-201ENSMUST00000105910 986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Limd1Q9QXD8 B9d2-201ENSMUST00000108403 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Limd1Q9QXD8 Tpt1-201ENSMUST00000110894 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Limd1Q9QXD8 Gm13418-201ENSMUST00000119097 944 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Limd1Q9QXD8 Mfap2-203ENSMUST00000166376 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Limd1Q9QXD8 Gm5867-201ENSMUST00000063197 592 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Limd1Q9QXD8 Gm5145-201ENSMUST00000095633 837 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
Limd1Q9QXD8 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Limd1Q9QXD8 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Limd1Q9QXD8 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Limd1Q9QXD8 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Limd1Q9QXD8 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Limd1Q9QXD8 Sbf2-213ENSMUST00000171218 1476 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Limd1Q9QXD8 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Limd1Q9QXD8 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Limd1Q9QXD8 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Limd1Q9QXD8 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Limd1Q9QXD8 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Limd1Q9QXD8 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Limd1Q9QXD8 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Limd1Q9QXD8 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Limd1Q9QXD8 Gm12350-201ENSMUST00000121208 462 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Limd1Q9QXD8 Cox6c-205ENSMUST00000156915 606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.6 ms