Protein–RNA interactions for Protein: Q9QWW1

Homer2, Homer protein homolog 2, mousemouse

Predictions only

Length 354 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Homer2Q9QWW1 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Homer2Q9QWW1 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Homer2Q9QWW1 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Homer2Q9QWW1 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Homer2Q9QWW1 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Homer2Q9QWW1 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Homer2Q9QWW1 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Homer2Q9QWW1 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Homer2Q9QWW1 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Homer2Q9QWW1 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Homer2Q9QWW1 St8sia6-201ENSMUST00000003509 7618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Homer2Q9QWW1 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Homer2Q9QWW1 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Homer2Q9QWW1 Gm11452-201ENSMUST00000122376 690 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Homer2Q9QWW1 Hnrnpa1l2-ps-201ENSMUST00000129154 964 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Homer2Q9QWW1 Fxyd5-208ENSMUST00000161805 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Homer2Q9QWW1 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Homer2Q9QWW1 Shisa5-218ENSMUST00000200515 1005 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Homer2Q9QWW1 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Homer2Q9QWW1 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Homer2Q9QWW1 Idnk-201ENSMUST00000051490 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Homer2Q9QWW1 Camsap1-202ENSMUST00000114167 7981 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Homer2Q9QWW1 Camsap1-201ENSMUST00000091268 7978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Homer2Q9QWW1 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Homer2Q9QWW1 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Homer2Q9QWW1 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Homer2Q9QWW1 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Homer2Q9QWW1 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Homer2Q9QWW1 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Homer2Q9QWW1 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Homer2Q9QWW1 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Homer2Q9QWW1 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Homer2Q9QWW1 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Homer2Q9QWW1 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Homer2Q9QWW1 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Homer2Q9QWW1 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Homer2Q9QWW1 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Homer2Q9QWW1 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Homer2Q9QWW1 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Homer2Q9QWW1 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Homer2Q9QWW1 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Homer2Q9QWW1 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Homer2Q9QWW1 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Homer2Q9QWW1 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Homer2Q9QWW1 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Homer2Q9QWW1 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Homer2Q9QWW1 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Homer2Q9QWW1 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Homer2Q9QWW1 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Homer2Q9QWW1 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Homer2Q9QWW1 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Homer2Q9QWW1 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Homer2Q9QWW1 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Homer2Q9QWW1 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Homer2Q9QWW1 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Homer2Q9QWW1 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Homer2Q9QWW1 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Homer2Q9QWW1 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Homer2Q9QWW1 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Homer2Q9QWW1 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Homer2Q9QWW1 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Homer2Q9QWW1 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Homer2Q9QWW1 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Homer2Q9QWW1 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Homer2Q9QWW1 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Homer2Q9QWW1 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Homer2Q9QWW1 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Homer2Q9QWW1 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Homer2Q9QWW1 Mrps18a-201ENSMUST00000024763 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Homer2Q9QWW1 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Homer2Q9QWW1 Dgcr6-202ENSMUST00000076757 894 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Homer2Q9QWW1 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Homer2Q9QWW1 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Homer2Q9QWW1 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Homer2Q9QWW1 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Homer2Q9QWW1 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Homer2Q9QWW1 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Homer2Q9QWW1 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Homer2Q9QWW1 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Homer2Q9QWW1 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Homer2Q9QWW1 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Homer2Q9QWW1 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Homer2Q9QWW1 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Homer2Q9QWW1 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Homer2Q9QWW1 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Homer2Q9QWW1 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Homer2Q9QWW1 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Homer2Q9QWW1 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Homer2Q9QWW1 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Homer2Q9QWW1 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Homer2Q9QWW1 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Homer2Q9QWW1 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Homer2Q9QWW1 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Homer2Q9QWW1 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Homer2Q9QWW1 AC159301.1-201ENSMUST00000225130 1182 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Homer2Q9QWW1 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Homer2Q9QWW1 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Homer2Q9QWW1 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Homer2Q9QWW1 Agps-201ENSMUST00000047232 7359 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Homer2Q9QWW1 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.5 ms