Protein–RNA interactions for Protein: Q9JM73

Srf, Serum response factor, mousemouse

Predictions only

Length 504 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SrfQ9JM73 Ilkap-201ENSMUST00000027534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SrfQ9JM73 Gstt2-201ENSMUST00000038257 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SrfQ9JM73 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SrfQ9JM73 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SrfQ9JM73 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SrfQ9JM73 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SrfQ9JM73 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SrfQ9JM73 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SrfQ9JM73 Gm10518-201ENSMUST00000097454 1301 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SrfQ9JM73 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SrfQ9JM73 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SrfQ9JM73 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SrfQ9JM73 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SrfQ9JM73 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SrfQ9JM73 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SrfQ9JM73 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SrfQ9JM73 Gm23935-201ENSMUST00000102303 57 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
SrfQ9JM73 Gm24270-201ENSMUST00000102326 57 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
SrfQ9JM73 Fam3a-203ENSMUST00000114139 931 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SrfQ9JM73 Gm13830-202ENSMUST00000144202 381 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SrfQ9JM73 Gm24245-201ENSMUST00000157318 57 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
SrfQ9JM73 Egfl7-216ENSMUST00000174211 1163 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SrfQ9JM73 Gm38575-201ENSMUST00000213881 652 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SrfQ9JM73 Fmr1nb-201ENSMUST00000069731 799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SrfQ9JM73 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SrfQ9JM73 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SrfQ9JM73 Zcwpw2-202ENSMUST00000187329 1469 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SrfQ9JM73 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SrfQ9JM73 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SrfQ9JM73 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
SrfQ9JM73 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SrfQ9JM73 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SrfQ9JM73 Gm11764-201ENSMUST00000120221 623 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
SrfQ9JM73 1700028B04Rik-202ENSMUST00000190841 971 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SrfQ9JM73 Gm43371-201ENSMUST00000202838 1031 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
SrfQ9JM73 Gm31545-201ENSMUST00000209358 1219 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SrfQ9JM73 1700012D14Rik-201ENSMUST00000209597 605 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SrfQ9JM73 Gm32050-201ENSMUST00000209793 638 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SrfQ9JM73 AC161424.1-202ENSMUST00000213570 767 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SrfQ9JM73 AC090659.1-201ENSMUST00000224334 768 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
SrfQ9JM73 AC154532.1-201ENSMUST00000227860 965 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
SrfQ9JM73 Gnmt-201ENSMUST00000002846 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SrfQ9JM73 Atp6v0b-201ENSMUST00000036380 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SrfQ9JM73 Nap1l1-206ENSMUST00000219143 1365 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SrfQ9JM73 Krt16-201ENSMUST00000007280 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SrfQ9JM73 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SrfQ9JM73 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SrfQ9JM73 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SrfQ9JM73 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SrfQ9JM73 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SrfQ9JM73 1700029H14Rik-203ENSMUST00000134023 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SrfQ9JM73 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SrfQ9JM73 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SrfQ9JM73 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SrfQ9JM73 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SrfQ9JM73 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SrfQ9JM73 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SrfQ9JM73 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SrfQ9JM73 Cnn2-202ENSMUST00000105374 926 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SrfQ9JM73 Etfrf1-204ENSMUST00000111723 842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SrfQ9JM73 Gm13962-201ENSMUST00000131512 611 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SrfQ9JM73 Gm15246-201ENSMUST00000149873 540 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SrfQ9JM73 Rab10os-206ENSMUST00000179908 746 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SrfQ9JM73 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
SrfQ9JM73 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SrfQ9JM73 Crb3-201ENSMUST00000071826 1194 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SrfQ9JM73 Lhb-201ENSMUST00000072453 678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SrfQ9JM73 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SrfQ9JM73 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SrfQ9JM73 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SrfQ9JM73 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SrfQ9JM73 Gipc2-201ENSMUST00000046614 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SrfQ9JM73 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SrfQ9JM73 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SrfQ9JM73 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SrfQ9JM73 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SrfQ9JM73 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
SrfQ9JM73 Tmsb4x-202ENSMUST00000112175 864 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SrfQ9JM73 Mir8117-201ENSMUST00000184773 107 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
SrfQ9JM73 Ighv1-15-201ENSMUST00000192077 351 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SrfQ9JM73 AC110091.2-202ENSMUST00000216718 1148 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SrfQ9JM73 Cd302-201ENSMUST00000028356 1257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SrfQ9JM73 Hacd1-201ENSMUST00000074854 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SrfQ9JM73 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SrfQ9JM73 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SrfQ9JM73 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SrfQ9JM73 Gjb1-203ENSMUST00000119190 1585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SrfQ9JM73 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SrfQ9JM73 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SrfQ9JM73 Lhpp-201ENSMUST00000033241 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SrfQ9JM73 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SrfQ9JM73 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SrfQ9JM73 Il11ra2-201ENSMUST00000108006 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SrfQ9JM73 Tmem217-201ENSMUST00000114683 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SrfQ9JM73 Edn3-203ENSMUST00000140908 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SrfQ9JM73 Gssos1-201ENSMUST00000142509 716 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SrfQ9JM73 Tcp1-207ENSMUST00000143961 614 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SrfQ9JM73 Psma6-204ENSMUST00000163070 787 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SrfQ9JM73 AL669916.2-201ENSMUST00000213219 358 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SrfQ9JM73 Batf-201ENSMUST00000040536 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.2 ms