Protein–RNA interactions for Protein: Q9JL56

Gde1, Glycerophosphodiester phosphodiesterase 1, mousemouse

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Length 331 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gde1Q9JL56 Higd1b-202ENSMUST00000107072 497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gde1Q9JL56 Higd1b-203ENSMUST00000107073 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gde1Q9JL56 Ptpa-208ENSMUST00000131476 989 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gde1Q9JL56 Egfl8-201ENSMUST00000015611 1150 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gde1Q9JL56 Gm17114-201ENSMUST00000164716 511 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gde1Q9JL56 Calcb-203ENSMUST00000182816 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gde1Q9JL56 D530014G21Rik-201ENSMUST00000208416 587 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gde1Q9JL56 Higd1b-201ENSMUST00000021302 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gde1Q9JL56 AC154222.1-201ENSMUST00000223882 475 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Gde1Q9JL56 BC031181-201ENSMUST00000040284 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gde1Q9JL56 Egfl8-202ENSMUST00000097345 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gde1Q9JL56 Gm37500-201ENSMUST00000192059 1443 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Gde1Q9JL56 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gde1Q9JL56 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gde1Q9JL56 Gm28111-201ENSMUST00000187786 1393 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gde1Q9JL56 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gde1Q9JL56 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Gde1Q9JL56 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Gde1Q9JL56 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Gde1Q9JL56 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Gde1Q9JL56 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Gde1Q9JL56 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Gde1Q9JL56 Cdpf1-203ENSMUST00000134631 786 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Gde1Q9JL56 Pmf1-205ENSMUST00000193338 795 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Gde1Q9JL56 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Gde1Q9JL56 4931406C07Rik-209ENSMUST00000217042 691 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
Gde1Q9JL56 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Gde1Q9JL56 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Gde1Q9JL56 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Gde1Q9JL56 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Gde1Q9JL56 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Gde1Q9JL56 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Gde1Q9JL56 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Gde1Q9JL56 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gde1Q9JL56 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gde1Q9JL56 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gde1Q9JL56 Gm26608-201ENSMUST00000180740 1954 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gde1Q9JL56 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gde1Q9JL56 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gde1Q9JL56 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gde1Q9JL56 Nt5c-202ENSMUST00000106530 836 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gde1Q9JL56 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gde1Q9JL56 Tpt1-205ENSMUST00000142061 996 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gde1Q9JL56 Hsd3b2-203ENSMUST00000177651 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gde1Q9JL56 Gm42670-201ENSMUST00000201816 1292 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Gde1Q9JL56 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Gde1Q9JL56 Nmur1-203ENSMUST00000212541 1534 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gde1Q9JL56 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gde1Q9JL56 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gde1Q9JL56 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gde1Q9JL56 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gde1Q9JL56 Gm11127-201ENSMUST00000113742 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gde1Q9JL56 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gde1Q9JL56 Gnb2-212ENSMUST00000150063 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gde1Q9JL56 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gde1Q9JL56 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gde1Q9JL56 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gde1Q9JL56 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gde1Q9JL56 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gde1Q9JL56 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gde1Q9JL56 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gde1Q9JL56 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gde1Q9JL56 Gm7222-201ENSMUST00000117512 906 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
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Gde1Q9JL56 Gm16838-201ENSMUST00000144594 816 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gde1Q9JL56 Banf1-202ENSMUST00000170010 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
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Gde1Q9JL56 Hist1h2bn-201ENSMUST00000091709 381 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gde1Q9JL56 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gde1Q9JL56 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gde1Q9JL56 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gde1Q9JL56 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gde1Q9JL56 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gde1Q9JL56 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gde1Q9JL56 Gm3928-201ENSMUST00000121141 1307 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Gde1Q9JL56 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gde1Q9JL56 Enoph1-201ENSMUST00000031268 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gde1Q9JL56 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gde1Q9JL56 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gde1Q9JL56 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gde1Q9JL56 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gde1Q9JL56 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gde1Q9JL56 Gm14140-201ENSMUST00000119999 995 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Gde1Q9JL56 Rpl39l-202ENSMUST00000121292 550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gde1Q9JL56 Gm11536-201ENSMUST00000130733 535 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gde1Q9JL56 Ctcflos-201ENSMUST00000142165 469 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gde1Q9JL56 Fahd2a-201ENSMUST00000028848 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gde1Q9JL56 Igflr1-201ENSMUST00000043850 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gde1Q9JL56 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gde1Q9JL56 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Gde1Q9JL56 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gde1Q9JL56 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gde1Q9JL56 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gde1Q9JL56 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Gde1Q9JL56 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gde1Q9JL56 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gde1Q9JL56 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.1 ms