Protein–RNA interactions for Protein: Q9JL35

Hmgn5, High mobility group nucleosome-binding domain-containing protein 5, mousemouse

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Length 406 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hmgn5Q9JL35 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Hmgn5Q9JL35 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Hmgn5Q9JL35 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Hmgn5Q9JL35 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Hmgn5Q9JL35 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Hmgn5Q9JL35 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Hmgn5Q9JL35 Pcdha2-201ENSMUST00000115662 5361 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Hmgn5Q9JL35 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Hmgn5Q9JL35 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Hmgn5Q9JL35 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Hmgn5Q9JL35 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Hmgn5Q9JL35 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Hmgn5Q9JL35 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Hmgn5Q9JL35 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Hmgn5Q9JL35 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Hmgn5Q9JL35 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Hmgn5Q9JL35 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Hmgn5Q9JL35 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Hmgn5Q9JL35 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Hmgn5Q9JL35 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Hmgn5Q9JL35 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Hmgn5Q9JL35 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Hmgn5Q9JL35 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Hmgn5Q9JL35 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Hmgn5Q9JL35 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Hmgn5Q9JL35 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Hmgn5Q9JL35 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Hmgn5Q9JL35 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Hmgn5Q9JL35 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Hmgn5Q9JL35 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Hmgn5Q9JL35 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Hmgn5Q9JL35 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Hmgn5Q9JL35 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Hmgn5Q9JL35 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Hmgn5Q9JL35 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Hmgn5Q9JL35 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Hmgn5Q9JL35 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Hmgn5Q9JL35 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Hmgn5Q9JL35 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Hmgn5Q9JL35 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Hmgn5Q9JL35 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Hmgn5Q9JL35 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Hmgn5Q9JL35 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Hmgn5Q9JL35 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Hmgn5Q9JL35 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Hmgn5Q9JL35 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Hmgn5Q9JL35 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Hmgn5Q9JL35 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Hmgn5Q9JL35 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Hmgn5Q9JL35 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Hmgn5Q9JL35 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Hmgn5Q9JL35 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Hmgn5Q9JL35 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Hmgn5Q9JL35 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Hmgn5Q9JL35 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Hmgn5Q9JL35 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Hmgn5Q9JL35 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Hmgn5Q9JL35 Dlc1-203ENSMUST00000098826 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Hmgn5Q9JL35 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Hmgn5Q9JL35 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Hmgn5Q9JL35 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Hmgn5Q9JL35 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Hmgn5Q9JL35 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Hmgn5Q9JL35 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Hmgn5Q9JL35 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Hmgn5Q9JL35 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Hmgn5Q9JL35 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Hmgn5Q9JL35 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Hmgn5Q9JL35 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Hmgn5Q9JL35 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Hmgn5Q9JL35 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Hmgn5Q9JL35 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
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Hmgn5Q9JL35 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Hmgn5Q9JL35 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Hmgn5Q9JL35 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Hmgn5Q9JL35 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Hmgn5Q9JL35 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Hmgn5Q9JL35 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Hmgn5Q9JL35 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Hmgn5Q9JL35 Agap1-202ENSMUST00000074945 10069 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Hmgn5Q9JL35 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Hmgn5Q9JL35 Hip1r-201ENSMUST00000000939 6735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Hmgn5Q9JL35 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Hmgn5Q9JL35 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Hmgn5Q9JL35 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Hmgn5Q9JL35 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Hmgn5Q9JL35 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Hmgn5Q9JL35 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Hmgn5Q9JL35 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Hmgn5Q9JL35 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Hmgn5Q9JL35 Slc12a5-207ENSMUST00000202223 5690 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Hmgn5Q9JL35 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Hmgn5Q9JL35 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Hmgn5Q9JL35 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Hmgn5Q9JL35 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Hmgn5Q9JL35 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Hmgn5Q9JL35 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Hmgn5Q9JL35 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Hmgn5Q9JL35 Ubn1-201ENSMUST00000052449 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
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