Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKZ2

Slc5a3, Sodium/myo-inositol cotransporter, mousemouse

Predictions only

Length 718 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc5a3Q9JKZ2 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Slc5a3Q9JKZ2 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Slc5a3Q9JKZ2 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Slc5a3Q9JKZ2 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Slc5a3Q9JKZ2 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Slc5a3Q9JKZ2 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Slc5a3Q9JKZ2 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Slc5a3Q9JKZ2 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Slc5a3Q9JKZ2 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Slc5a3Q9JKZ2 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Slc5a3Q9JKZ2 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Slc5a3Q9JKZ2 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Slc5a3Q9JKZ2 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Slc5a3Q9JKZ2 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Slc5a3Q9JKZ2 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Slc5a3Q9JKZ2 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Slc5a3Q9JKZ2 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Slc5a3Q9JKZ2 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Slc5a3Q9JKZ2 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Slc5a3Q9JKZ2 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Slc5a3Q9JKZ2 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Slc5a3Q9JKZ2 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Slc5a3Q9JKZ2 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Slc5a3Q9JKZ2 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Slc5a3Q9JKZ2 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Slc5a3Q9JKZ2 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Slc5a3Q9JKZ2 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Slc5a3Q9JKZ2 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Slc5a3Q9JKZ2 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Slc5a3Q9JKZ2 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Slc5a3Q9JKZ2 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Slc5a3Q9JKZ2 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Slc5a3Q9JKZ2 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Slc5a3Q9JKZ2 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Slc5a3Q9JKZ2 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Slc5a3Q9JKZ2 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Slc5a3Q9JKZ2 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Slc5a3Q9JKZ2 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Slc5a3Q9JKZ2 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Slc5a3Q9JKZ2 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Slc5a3Q9JKZ2 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Slc5a3Q9JKZ2 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Slc5a3Q9JKZ2 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Slc5a3Q9JKZ2 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Slc5a3Q9JKZ2 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Slc5a3Q9JKZ2 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Slc5a3Q9JKZ2 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Slc5a3Q9JKZ2 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Slc5a3Q9JKZ2 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Slc5a3Q9JKZ2 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Slc5a3Q9JKZ2 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Slc5a3Q9JKZ2 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Slc5a3Q9JKZ2 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Slc5a3Q9JKZ2 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Slc5a3Q9JKZ2 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Slc5a3Q9JKZ2 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Slc5a3Q9JKZ2 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Slc5a3Q9JKZ2 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Slc5a3Q9JKZ2 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Slc5a3Q9JKZ2 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Slc5a3Q9JKZ2 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Slc5a3Q9JKZ2 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Slc5a3Q9JKZ2 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Slc5a3Q9JKZ2 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Slc5a3Q9JKZ2 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Slc5a3Q9JKZ2 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Slc5a3Q9JKZ2 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Slc5a3Q9JKZ2 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Slc5a3Q9JKZ2 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Slc5a3Q9JKZ2 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Slc5a3Q9JKZ2 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Slc5a3Q9JKZ2 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Slc5a3Q9JKZ2 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Slc5a3Q9JKZ2 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Slc5a3Q9JKZ2 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Slc5a3Q9JKZ2 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Slc5a3Q9JKZ2 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Slc5a3Q9JKZ2 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Slc5a3Q9JKZ2 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Slc5a3Q9JKZ2 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Slc5a3Q9JKZ2 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Slc5a3Q9JKZ2 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Slc5a3Q9JKZ2 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Slc5a3Q9JKZ2 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Slc5a3Q9JKZ2 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Slc5a3Q9JKZ2 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Slc5a3Q9JKZ2 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Slc5a3Q9JKZ2 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Slc5a3Q9JKZ2 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Slc5a3Q9JKZ2 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Slc5a3Q9JKZ2 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Slc5a3Q9JKZ2 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Slc5a3Q9JKZ2 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Slc5a3Q9JKZ2 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Slc5a3Q9JKZ2 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Slc5a3Q9JKZ2 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Slc5a3Q9JKZ2 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Slc5a3Q9JKZ2 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Slc5a3Q9JKZ2 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Slc5a3Q9JKZ2 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.4 ms