Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKS5

Habp4, Intracellular hyaluronan-binding protein 4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 411 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Habp4Q9JKS5 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Habp4Q9JKS5 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Habp4Q9JKS5 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Habp4Q9JKS5 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Habp4Q9JKS5 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Habp4Q9JKS5 Taz-202ENSMUST00000114180 1786 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Habp4Q9JKS5 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Habp4Q9JKS5 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Habp4Q9JKS5 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Habp4Q9JKS5 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Habp4Q9JKS5 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Habp4Q9JKS5 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Habp4Q9JKS5 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Habp4Q9JKS5 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Habp4Q9JKS5 AC151286.1-201ENSMUST00000198489 145 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Habp4Q9JKS5 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Habp4Q9JKS5 Myl12b-201ENSMUST00000038446 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Habp4Q9JKS5 Cdkn2d-201ENSMUST00000086374 1264 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Habp4Q9JKS5 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Habp4Q9JKS5 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Habp4Q9JKS5 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Habp4Q9JKS5 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Habp4Q9JKS5 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Habp4Q9JKS5 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Habp4Q9JKS5 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Habp4Q9JKS5 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Habp4Q9JKS5 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Habp4Q9JKS5 Gbp5-201ENSMUST00000090127 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Habp4Q9JKS5 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Habp4Q9JKS5 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Habp4Q9JKS5 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Habp4Q9JKS5 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Habp4Q9JKS5 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Habp4Q9JKS5 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Habp4Q9JKS5 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Habp4Q9JKS5 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Habp4Q9JKS5 Dnajc2-202ENSMUST00000115192 1132 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Habp4Q9JKS5 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Habp4Q9JKS5 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Habp4Q9JKS5 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Habp4Q9JKS5 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Habp4Q9JKS5 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Habp4Q9JKS5 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Habp4Q9JKS5 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Habp4Q9JKS5 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Habp4Q9JKS5 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Habp4Q9JKS5 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Habp4Q9JKS5 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Habp4Q9JKS5 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Habp4Q9JKS5 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Habp4Q9JKS5 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Habp4Q9JKS5 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Habp4Q9JKS5 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Habp4Q9JKS5 Gm13849-201ENSMUST00000153328 835 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Habp4Q9JKS5 Gm27321-201ENSMUST00000185021 205 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Habp4Q9JKS5 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Habp4Q9JKS5 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Habp4Q9JKS5 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Habp4Q9JKS5 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Habp4Q9JKS5 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Habp4Q9JKS5 Aire-213ENSMUST00000148469 1618 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Habp4Q9JKS5 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Habp4Q9JKS5 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Habp4Q9JKS5 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Habp4Q9JKS5 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Habp4Q9JKS5 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Habp4Q9JKS5 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Habp4Q9JKS5 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Habp4Q9JKS5 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Habp4Q9JKS5 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Habp4Q9JKS5 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Habp4Q9JKS5 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Habp4Q9JKS5 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Habp4Q9JKS5 Rasd2-201ENSMUST00000132133 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Habp4Q9JKS5 Gm44107-201ENSMUST00000203242 573 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Habp4Q9JKS5 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Habp4Q9JKS5 Timm13-201ENSMUST00000020440 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Habp4Q9JKS5 Fam26f-201ENSMUST00000062784 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Habp4Q9JKS5 Fmr1nb-201ENSMUST00000069731 799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Habp4Q9JKS5 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Habp4Q9JKS5 Ndufb6-201ENSMUST00000095128 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Habp4Q9JKS5 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Habp4Q9JKS5 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Habp4Q9JKS5 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Habp4Q9JKS5 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Habp4Q9JKS5 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Habp4Q9JKS5 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Habp4Q9JKS5 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Habp4Q9JKS5 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Habp4Q9JKS5 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Habp4Q9JKS5 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Habp4Q9JKS5 4933433G15Rik-201ENSMUST00000180533 1481 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Habp4Q9JKS5 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Habp4Q9JKS5 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Habp4Q9JKS5 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Habp4Q9JKS5 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Habp4Q9JKS5 Klk6-202ENSMUST00000107967 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Habp4Q9JKS5 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Habp4Q9JKS5 Gm11750-201ENSMUST00000146016 583 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Habp4Q9JKS5 Hsd3b2-203ENSMUST00000177651 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.6 ms