Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKS4

Ldb3, LIM domain-binding protein 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 723 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ldb3Q9JKS4 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ldb3Q9JKS4 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ldb3Q9JKS4 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ldb3Q9JKS4 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ldb3Q9JKS4 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ldb3Q9JKS4 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ldb3Q9JKS4 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ldb3Q9JKS4 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ldb3Q9JKS4 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ldb3Q9JKS4 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ldb3Q9JKS4 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ldb3Q9JKS4 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Ldb3Q9JKS4 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ldb3Q9JKS4 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ldb3Q9JKS4 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ldb3Q9JKS4 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ldb3Q9JKS4 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ldb3Q9JKS4 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ldb3Q9JKS4 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ldb3Q9JKS4 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ldb3Q9JKS4 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ldb3Q9JKS4 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ldb3Q9JKS4 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ldb3Q9JKS4 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ldb3Q9JKS4 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Ldb3Q9JKS4 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ldb3Q9JKS4 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ldb3Q9JKS4 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ldb3Q9JKS4 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ldb3Q9JKS4 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ldb3Q9JKS4 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ldb3Q9JKS4 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ldb3Q9JKS4 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ldb3Q9JKS4 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ldb3Q9JKS4 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ldb3Q9JKS4 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ldb3Q9JKS4 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ldb3Q9JKS4 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Ldb3Q9JKS4 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ldb3Q9JKS4 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ldb3Q9JKS4 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ldb3Q9JKS4 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ldb3Q9JKS4 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ldb3Q9JKS4 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ldb3Q9JKS4 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ldb3Q9JKS4 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ldb3Q9JKS4 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ldb3Q9JKS4 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ldb3Q9JKS4 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ldb3Q9JKS4 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ldb3Q9JKS4 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ldb3Q9JKS4 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ldb3Q9JKS4 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ldb3Q9JKS4 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ldb3Q9JKS4 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ldb3Q9JKS4 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ldb3Q9JKS4 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ldb3Q9JKS4 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ldb3Q9JKS4 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ldb3Q9JKS4 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ldb3Q9JKS4 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ldb3Q9JKS4 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ldb3Q9JKS4 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ldb3Q9JKS4 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ldb3Q9JKS4 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Ldb3Q9JKS4 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Ldb3Q9JKS4 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ldb3Q9JKS4 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ldb3Q9JKS4 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ldb3Q9JKS4 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ldb3Q9JKS4 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ldb3Q9JKS4 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ldb3Q9JKS4 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ldb3Q9JKS4 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ldb3Q9JKS4 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ldb3Q9JKS4 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ldb3Q9JKS4 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ldb3Q9JKS4 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ldb3Q9JKS4 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ldb3Q9JKS4 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ldb3Q9JKS4 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ldb3Q9JKS4 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ldb3Q9JKS4 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ldb3Q9JKS4 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ldb3Q9JKS4 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ldb3Q9JKS4 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ldb3Q9JKS4 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ldb3Q9JKS4 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ldb3Q9JKS4 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ldb3Q9JKS4 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ldb3Q9JKS4 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ldb3Q9JKS4 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ldb3Q9JKS4 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ldb3Q9JKS4 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ldb3Q9JKS4 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ldb3Q9JKS4 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ldb3Q9JKS4 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ldb3Q9JKS4 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Ldb3Q9JKS4 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ldb3Q9JKS4 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.6 ms