Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKE2

Trem1, Triggering receptor expressed on myeloid cells 1, mousemouse

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Length 230 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trem1Q9JKE2 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Trem1Q9JKE2 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Trem1Q9JKE2 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Trem1Q9JKE2 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Trem1Q9JKE2 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Trem1Q9JKE2 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Trem1Q9JKE2 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Trem1Q9JKE2 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Trem1Q9JKE2 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Trem1Q9JKE2 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Trem1Q9JKE2 Efnb1-201ENSMUST00000052839 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Trem1Q9JKE2 Zfp219-201ENSMUST00000067549 2933 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Trem1Q9JKE2 Sec14l1-201ENSMUST00000021177 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Trem1Q9JKE2 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Trem1Q9JKE2 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Trem1Q9JKE2 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Trem1Q9JKE2 Slc44a3-201ENSMUST00000039197 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Trem1Q9JKE2 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Trem1Q9JKE2 Slc43a1-201ENSMUST00000028469 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Trem1Q9JKE2 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Trem1Q9JKE2 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Trem1Q9JKE2 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Trem1Q9JKE2 Arhgef5-201ENSMUST00000031750 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Trem1Q9JKE2 Rbbp9-201ENSMUST00000028915 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Trem1Q9JKE2 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Trem1Q9JKE2 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Trem1Q9JKE2 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Trem1Q9JKE2 Steap2-202ENSMUST00000115424 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Trem1Q9JKE2 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Trem1Q9JKE2 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Trem1Q9JKE2 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Trem1Q9JKE2 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Trem1Q9JKE2 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Trem1Q9JKE2 Senp1-204ENSMUST00000180657 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Trem1Q9JKE2 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Trem1Q9JKE2 Trappc9-203ENSMUST00000168191 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Trem1Q9JKE2 Tle1-202ENSMUST00000072695 3644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Trem1Q9JKE2 Fbxo3-201ENSMUST00000028603 4740 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Trem1Q9JKE2 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Trem1Q9JKE2 Gm9768-201ENSMUST00000206007 2861 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Trem1Q9JKE2 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Trem1Q9JKE2 Camta1-203ENSMUST00000105668 4962 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Trem1Q9JKE2 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Trem1Q9JKE2 Mpzl2-201ENSMUST00000034600 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Trem1Q9JKE2 Usp31-201ENSMUST00000046929 10198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Trem1Q9JKE2 Arhgef10l-206ENSMUST00000105799 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Trem1Q9JKE2 Celf3-204ENSMUST00000197558 2414 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Trem1Q9JKE2 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Trem1Q9JKE2 Nup54-201ENSMUST00000038514 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Trem1Q9JKE2 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Trem1Q9JKE2 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Trem1Q9JKE2 Gm26793-201ENSMUST00000180930 2732 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Trem1Q9JKE2 Ispd-202ENSMUST00000220519 3122 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Trem1Q9JKE2 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Trem1Q9JKE2 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Trem1Q9JKE2 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Trem1Q9JKE2 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Trem1Q9JKE2 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Trem1Q9JKE2 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Trem1Q9JKE2 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Trem1Q9JKE2 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Trem1Q9JKE2 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Trem1Q9JKE2 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Trem1Q9JKE2 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Trem1Q9JKE2 Tnfaip8l1-201ENSMUST00000077788 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Trem1Q9JKE2 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Trem1Q9JKE2 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Trem1Q9JKE2 Muc3a-201ENSMUST00000179412 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Trem1Q9JKE2 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Trem1Q9JKE2 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Trem1Q9JKE2 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Trem1Q9JKE2 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Trem1Q9JKE2 Fam102a-201ENSMUST00000048375 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Trem1Q9JKE2 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Trem1Q9JKE2 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Trem1Q9JKE2 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Trem1Q9JKE2 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Trem1Q9JKE2 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Trem1Q9JKE2 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Trem1Q9JKE2 Gm43951-201ENSMUST00000204457 2889 ntAPPRIS P1 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Trem1Q9JKE2 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Trem1Q9JKE2 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Trem1Q9JKE2 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Trem1Q9JKE2 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Trem1Q9JKE2 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Trem1Q9JKE2 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Trem1Q9JKE2 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Trem1Q9JKE2 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Trem1Q9JKE2 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Trem1Q9JKE2 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Trem1Q9JKE2 Ddx20-201ENSMUST00000090680 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Trem1Q9JKE2 Cdhr5-202ENSMUST00000167263 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Trem1Q9JKE2 Tarsl2-201ENSMUST00000032728 3192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Trem1Q9JKE2 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Trem1Q9JKE2 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Trem1Q9JKE2 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Trem1Q9JKE2 Clcn2-201ENSMUST00000007207 3128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Trem1Q9JKE2 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Trem1Q9JKE2 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Trem1Q9JKE2 Snph-204ENSMUST00000109877 3367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
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