Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJT2

Gfra4, GDNF family receptor alpha-4, mousemouse

Predictions only

Length 260 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gfra4Q9JJT2 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Gfra4Q9JJT2 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Gfra4Q9JJT2 Nkapl-201ENSMUST00000068235 1463 ntAPPRIS P1 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Gfra4Q9JJT2 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Gfra4Q9JJT2 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Gfra4Q9JJT2 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Gfra4Q9JJT2 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Gfra4Q9JJT2 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Gfra4Q9JJT2 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Gfra4Q9JJT2 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Gfra4Q9JJT2 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Gfra4Q9JJT2 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Gfra4Q9JJT2 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Gfra4Q9JJT2 1810062O18Rik-203ENSMUST00000129237 647 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Gfra4Q9JJT2 Lrrc3c-201ENSMUST00000142268 902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Gfra4Q9JJT2 Urah-204ENSMUST00000185612 716 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Gfra4Q9JJT2 Gm30191-201ENSMUST00000205501 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Gfra4Q9JJT2 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Gfra4Q9JJT2 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Gfra4Q9JJT2 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Gfra4Q9JJT2 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Gfra4Q9JJT2 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Gfra4Q9JJT2 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Gfra4Q9JJT2 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Gfra4Q9JJT2 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Gfra4Q9JJT2 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Gfra4Q9JJT2 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Gfra4Q9JJT2 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Gfra4Q9JJT2 Gm14494-201ENSMUST00000118786 435 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
Gfra4Q9JJT2 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
Gfra4Q9JJT2 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Gfra4Q9JJT2 Mtus2-201ENSMUST00000071878 1211 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Gfra4Q9JJT2 Cdkn2d-201ENSMUST00000086374 1264 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Gfra4Q9JJT2 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Gfra4Q9JJT2 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Gfra4Q9JJT2 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Gfra4Q9JJT2 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Gfra4Q9JJT2 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Gfra4Q9JJT2 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Gfra4Q9JJT2 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Gfra4Q9JJT2 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Gfra4Q9JJT2 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Gfra4Q9JJT2 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Gfra4Q9JJT2 Dbi-207ENSMUST00000151708 491 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Gfra4Q9JJT2 H2-Bl-204ENSMUST00000184502 862 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Gfra4Q9JJT2 Gm27321-201ENSMUST00000185021 205 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Gfra4Q9JJT2 Sox2ot-202ENSMUST00000196058 753 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Gfra4Q9JJT2 Isg15-201ENSMUST00000085425 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Gfra4Q9JJT2 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Gfra4Q9JJT2 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Gfra4Q9JJT2 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Gfra4Q9JJT2 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Gfra4Q9JJT2 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Gfra4Q9JJT2 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Gfra4Q9JJT2 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Gfra4Q9JJT2 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Gfra4Q9JJT2 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Gfra4Q9JJT2 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Gfra4Q9JJT2 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Gfra4Q9JJT2 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Gfra4Q9JJT2 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Gfra4Q9JJT2 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Gfra4Q9JJT2 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Gfra4Q9JJT2 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Gfra4Q9JJT2 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Gfra4Q9JJT2 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Gfra4Q9JJT2 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Gfra4Q9JJT2 Gm12260-201ENSMUST00000122447 411 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Gfra4Q9JJT2 Gm44081-201ENSMUST00000204406 643 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Gfra4Q9JJT2 Cplx3-202ENSMUST00000215487 594 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Gfra4Q9JJT2 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Gfra4Q9JJT2 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Gfra4Q9JJT2 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Gfra4Q9JJT2 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Gfra4Q9JJT2 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Gfra4Q9JJT2 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Gfra4Q9JJT2 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Gfra4Q9JJT2 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Gfra4Q9JJT2 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Gfra4Q9JJT2 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Gfra4Q9JJT2 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Gfra4Q9JJT2 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Gfra4Q9JJT2 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Gfra4Q9JJT2 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Gfra4Q9JJT2 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Gfra4Q9JJT2 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Gfra4Q9JJT2 Mir5126-201ENSMUST00000175513 77 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Gfra4Q9JJT2 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Gfra4Q9JJT2 Gm26854-201ENSMUST00000180418 705 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Gfra4Q9JJT2 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Gfra4Q9JJT2 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Gfra4Q9JJT2 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Gfra4Q9JJT2 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Gfra4Q9JJT2 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Gfra4Q9JJT2 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Gfra4Q9JJT2 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Gfra4Q9JJT2 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Gfra4Q9JJT2 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Gfra4Q9JJT2 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Gfra4Q9JJT2 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.3 ms