Protein–RNA interactions for Protein: Q9JIG8

Praf2, PRA1 family protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 178 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Praf2Q9JIG8 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Praf2Q9JIG8 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Praf2Q9JIG8 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Praf2Q9JIG8 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Praf2Q9JIG8 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Praf2Q9JIG8 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Praf2Q9JIG8 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Praf2Q9JIG8 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Praf2Q9JIG8 Pitpnm2-209ENSMUST00000161938 5866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Praf2Q9JIG8 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Praf2Q9JIG8 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Praf2Q9JIG8 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Praf2Q9JIG8 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Praf2Q9JIG8 Tmem26-201ENSMUST00000080995 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Praf2Q9JIG8 Tle3-205ENSMUST00000159630 4065 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Praf2Q9JIG8 Tbc1d1-203ENSMUST00000119756 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Praf2Q9JIG8 Srsf11-204ENSMUST00000121326 3106 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Praf2Q9JIG8 Gm44443-201ENSMUST00000204396 5633 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Praf2Q9JIG8 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Praf2Q9JIG8 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Praf2Q9JIG8 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Praf2Q9JIG8 Pcdha5-201ENSMUST00000192168 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Praf2Q9JIG8 Zc3h13-203ENSMUST00000227049 6144 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Praf2Q9JIG8 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Praf2Q9JIG8 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Praf2Q9JIG8 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Praf2Q9JIG8 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Praf2Q9JIG8 Ppp4r3a-202ENSMUST00000163095 4083 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Praf2Q9JIG8 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Praf2Q9JIG8 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Praf2Q9JIG8 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Praf2Q9JIG8 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Praf2Q9JIG8 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Praf2Q9JIG8 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Praf2Q9JIG8 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Praf2Q9JIG8 Gxylt2-201ENSMUST00000032157 7658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Praf2Q9JIG8 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Praf2Q9JIG8 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Praf2Q9JIG8 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Praf2Q9JIG8 Ric8b-201ENSMUST00000038523 3069 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Praf2Q9JIG8 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Praf2Q9JIG8 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Praf2Q9JIG8 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Praf2Q9JIG8 Gatad2a-203ENSMUST00000177851 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Praf2Q9JIG8 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Praf2Q9JIG8 Pak2-201ENSMUST00000023467 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Praf2Q9JIG8 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Praf2Q9JIG8 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Praf2Q9JIG8 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Praf2Q9JIG8 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Praf2Q9JIG8 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Praf2Q9JIG8 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Praf2Q9JIG8 Tor1aip2-205ENSMUST00000111757 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Praf2Q9JIG8 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Praf2Q9JIG8 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Praf2Q9JIG8 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Praf2Q9JIG8 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Praf2Q9JIG8 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Praf2Q9JIG8 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Praf2Q9JIG8 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Praf2Q9JIG8 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Praf2Q9JIG8 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Praf2Q9JIG8 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Praf2Q9JIG8 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Praf2Q9JIG8 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Praf2Q9JIG8 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Praf2Q9JIG8 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Praf2Q9JIG8 Grid2-201ENSMUST00000095852 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Praf2Q9JIG8 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Praf2Q9JIG8 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Praf2Q9JIG8 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Praf2Q9JIG8 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Praf2Q9JIG8 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Praf2Q9JIG8 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Praf2Q9JIG8 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Praf2Q9JIG8 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Praf2Q9JIG8 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Praf2Q9JIG8 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Praf2Q9JIG8 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Praf2Q9JIG8 Naa15-201ENSMUST00000029303 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Praf2Q9JIG8 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Praf2Q9JIG8 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Praf2Q9JIG8 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Praf2Q9JIG8 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Praf2Q9JIG8 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Praf2Q9JIG8 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Praf2Q9JIG8 AC154412.1-201ENSMUST00000226540 2786 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Praf2Q9JIG8 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Praf2Q9JIG8 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Praf2Q9JIG8 Acsl3-201ENSMUST00000035779 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Praf2Q9JIG8 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Praf2Q9JIG8 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Praf2Q9JIG8 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Praf2Q9JIG8 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Praf2Q9JIG8 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Praf2Q9JIG8 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Praf2Q9JIG8 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Praf2Q9JIG8 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Praf2Q9JIG8 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Praf2Q9JIG8 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.7 ms