Protein–RNA interactions for Protein: Q9ESK9

Rb1cc1, RB1-inducible coiled-coil protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,588 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rb1cc1Q9ESK9 AC122301.2-201ENSMUST00000219020 1474 ntTSL 5 BASIC29.75■■■□□ 2.35
Rb1cc1Q9ESK9 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
Rb1cc1Q9ESK9 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
Rb1cc1Q9ESK9 Gpr160-207ENSMUST00000166278 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
Rb1cc1Q9ESK9 Meig1-203ENSMUST00000115082 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
Rb1cc1Q9ESK9 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC29.75■■■□□ 2.35
Rb1cc1Q9ESK9 March3-201ENSMUST00000035278 860 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.75■■■□□ 2.35
Rb1cc1Q9ESK9 Pitx2-203ENSMUST00000106382 1757 ntTSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
Rb1cc1Q9ESK9 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
Rb1cc1Q9ESK9 Lypd1-201ENSMUST00000027582 1447 ntTSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
Rb1cc1Q9ESK9 Gm26547-201ENSMUST00000181186 1508 ntTSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
Rb1cc1Q9ESK9 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
Rb1cc1Q9ESK9 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
Rb1cc1Q9ESK9 Dio1-202ENSMUST00000106748 396 ntTSL 5 BASIC29.74■■■□□ 2.35
Rb1cc1Q9ESK9 Ern1-202ENSMUST00000106799 660 ntTSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
Rb1cc1Q9ESK9 1700003M07Rik-202ENSMUST00000147634 564 ntTSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
Rb1cc1Q9ESK9 Msrb2-201ENSMUST00000023856 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
Rb1cc1Q9ESK9 Mt3-201ENSMUST00000034211 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
Rb1cc1Q9ESK9 Ndufs8-201ENSMUST00000075092 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
Rb1cc1Q9ESK9 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.74■■■□□ 2.35
Rb1cc1Q9ESK9 Mef2b-203ENSMUST00000110143 1312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
Rb1cc1Q9ESK9 4933434E20Rik-204ENSMUST00000159064 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
Rb1cc1Q9ESK9 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
Rb1cc1Q9ESK9 Larp1b-205ENSMUST00000191805 1581 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.74■■■□□ 2.35
Rb1cc1Q9ESK9 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
Rb1cc1Q9ESK9 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
Rb1cc1Q9ESK9 Dhdds-203ENSMUST00000105886 1015 ntTSL 5 BASIC29.73■■■□□ 2.35
Rb1cc1Q9ESK9 AC155714.1-201ENSMUST00000214033 956 ntTSL 5 BASIC29.73■■■□□ 2.35
Rb1cc1Q9ESK9 Orc6-201ENSMUST00000034132 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
Rb1cc1Q9ESK9 Gsdmcl1-201ENSMUST00000071847 1133 ntTSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
Rb1cc1Q9ESK9 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
Rb1cc1Q9ESK9 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.73■■■□□ 2.35
Rb1cc1Q9ESK9 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
Rb1cc1Q9ESK9 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
Rb1cc1Q9ESK9 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
Rb1cc1Q9ESK9 Ube2l6-201ENSMUST00000102642 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
Rb1cc1Q9ESK9 Caly-202ENSMUST00000166758 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
Rb1cc1Q9ESK9 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
Rb1cc1Q9ESK9 Clns1a-201ENSMUST00000026506 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
Rb1cc1Q9ESK9 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
Rb1cc1Q9ESK9 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
Rb1cc1Q9ESK9 Best4-ps-201ENSMUST00000129783 1380 ntBASIC29.72■■■□□ 2.35
Rb1cc1Q9ESK9 Pcp2-203ENSMUST00000133459 470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
Rb1cc1Q9ESK9 Gm20478-201ENSMUST00000173648 1031 ntTSL 3 BASIC29.72■■■□□ 2.35
Rb1cc1Q9ESK9 Gm30097-202ENSMUST00000194580 329 ntTSL 3 BASIC29.72■■■□□ 2.35
Rb1cc1Q9ESK9 Gdpd3-201ENSMUST00000032944 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
Rb1cc1Q9ESK9 Pcp2-201ENSMUST00000004749 495 ntTSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
Rb1cc1Q9ESK9 Hmgcl-201ENSMUST00000030432 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
Rb1cc1Q9ESK9 Gm38392-202ENSMUST00000165196 1303 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC29.71■■■□□ 2.35
Rb1cc1Q9ESK9 Psmb5-ps-201ENSMUST00000119744 798 ntBASIC29.71■■■□□ 2.35
Rb1cc1Q9ESK9 Gm28050-201ENSMUST00000124394 449 ntTSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
Rb1cc1Q9ESK9 Gm15655-201ENSMUST00000134649 440 ntTSL 2 BASIC29.71■■■□□ 2.35
Rb1cc1Q9ESK9 Gm30684-201ENSMUST00000205632 600 ntTSL 3 BASIC29.71■■■□□ 2.35
Rb1cc1Q9ESK9 Rhox6-201ENSMUST00000006362 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
Rb1cc1Q9ESK9 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
Rb1cc1Q9ESK9 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
Rb1cc1Q9ESK9 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
Rb1cc1Q9ESK9 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC29.71■■■□□ 2.35
Rb1cc1Q9ESK9 9130401M01Rik-201ENSMUST00000100655 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
Rb1cc1Q9ESK9 Cep250-203ENSMUST00000109618 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
Rb1cc1Q9ESK9 Sfxn5-203ENSMUST00000113787 638 ntTSL 2 BASIC29.7■■■□□ 2.35
Rb1cc1Q9ESK9 Gm13616-201ENSMUST00000120600 222 ntBASIC29.7■■■□□ 2.35
Rb1cc1Q9ESK9 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
Rb1cc1Q9ESK9 Rian-216ENSMUST00000183215 880 ntTSL 3 BASIC29.7■■■□□ 2.35
Rb1cc1Q9ESK9 Gm27494-201ENSMUST00000184735 189 ntBASIC29.7■■■□□ 2.35
Rb1cc1Q9ESK9 AC158804.1-201ENSMUST00000219046 541 ntTSL 3 BASIC29.7■■■□□ 2.35
Rb1cc1Q9ESK9 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
Rb1cc1Q9ESK9 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.34
Rb1cc1Q9ESK9 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.7■■■□□ 2.34
Rb1cc1Q9ESK9 Crhbp-202ENSMUST00000221025 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.34
Rb1cc1Q9ESK9 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.34
Rb1cc1Q9ESK9 Lancl1-203ENSMUST00000119559 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.34
Rb1cc1Q9ESK9 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC29.69■■■□□ 2.34
Rb1cc1Q9ESK9 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
Rb1cc1Q9ESK9 Josd2-202ENSMUST00000117324 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
Rb1cc1Q9ESK9 Gm44492-201ENSMUST00000197012 141 ntBASIC29.69■■■□□ 2.34
Rb1cc1Q9ESK9 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
Rb1cc1Q9ESK9 Tmem81-202ENSMUST00000188789 1751 ntAPPRIS P1 BASIC29.69■■■□□ 2.34
Rb1cc1Q9ESK9 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
Rb1cc1Q9ESK9 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
Rb1cc1Q9ESK9 Iqcd-201ENSMUST00000069259 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
Rb1cc1Q9ESK9 Gm14057-201ENSMUST00000120631 482 ntBASIC29.69■■■□□ 2.34
Rb1cc1Q9ESK9 Gm10605-201ENSMUST00000182342 665 ntTSL 3 BASIC29.69■■■□□ 2.34
Rb1cc1Q9ESK9 Mir6956-201ENSMUST00000183598 62 ntBASIC29.69■■■□□ 2.34
Rb1cc1Q9ESK9 Arl3-201ENSMUST00000026009 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
Rb1cc1Q9ESK9 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC29.69■■■□□ 2.34
Rb1cc1Q9ESK9 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
Rb1cc1Q9ESK9 Dnajc9-201ENSMUST00000022345 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
Rb1cc1Q9ESK9 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
Rb1cc1Q9ESK9 Polr2i-202ENSMUST00000108192 508 ntTSL 2 BASIC29.68■■■□□ 2.34
Rb1cc1Q9ESK9 Gm45612-201ENSMUST00000211320 160 ntBASIC29.68■■■□□ 2.34
Rb1cc1Q9ESK9 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
Rb1cc1Q9ESK9 Gimap3-201ENSMUST00000038811 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.67■■■□□ 2.34
Rb1cc1Q9ESK9 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
Rb1cc1Q9ESK9 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
Rb1cc1Q9ESK9 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
Rb1cc1Q9ESK9 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC29.67■■■□□ 2.34
Rb1cc1Q9ESK9 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC29.67■■■□□ 2.34
Rb1cc1Q9ESK9 Aimp2-202ENSMUST00000100483 1073 ntTSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
Rb1cc1Q9ESK9 Prmt7-203ENSMUST00000109297 1094 ntTSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.8 ms