Protein–RNA interactions for Protein: Q9ES63

Usp29, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 29, mousemouse

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Length 869 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp29Q9ES63 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Usp29Q9ES63 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Usp29Q9ES63 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Usp29Q9ES63 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Usp29Q9ES63 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Usp29Q9ES63 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Usp29Q9ES63 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Usp29Q9ES63 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Usp29Q9ES63 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Usp29Q9ES63 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Usp29Q9ES63 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Usp29Q9ES63 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Usp29Q9ES63 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Usp29Q9ES63 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Usp29Q9ES63 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Usp29Q9ES63 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Usp29Q9ES63 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Usp29Q9ES63 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Usp29Q9ES63 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Usp29Q9ES63 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Usp29Q9ES63 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Usp29Q9ES63 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Usp29Q9ES63 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Usp29Q9ES63 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Usp29Q9ES63 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Usp29Q9ES63 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Usp29Q9ES63 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Usp29Q9ES63 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Usp29Q9ES63 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Usp29Q9ES63 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Usp29Q9ES63 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Usp29Q9ES63 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Usp29Q9ES63 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Usp29Q9ES63 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Usp29Q9ES63 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Usp29Q9ES63 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Usp29Q9ES63 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Usp29Q9ES63 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Usp29Q9ES63 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Usp29Q9ES63 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Usp29Q9ES63 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Usp29Q9ES63 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Usp29Q9ES63 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Usp29Q9ES63 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Usp29Q9ES63 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Usp29Q9ES63 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Usp29Q9ES63 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Usp29Q9ES63 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Usp29Q9ES63 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Usp29Q9ES63 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Usp29Q9ES63 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Usp29Q9ES63 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Usp29Q9ES63 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Usp29Q9ES63 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Usp29Q9ES63 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Usp29Q9ES63 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Usp29Q9ES63 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Usp29Q9ES63 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Usp29Q9ES63 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Usp29Q9ES63 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Usp29Q9ES63 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Usp29Q9ES63 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Usp29Q9ES63 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Usp29Q9ES63 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Usp29Q9ES63 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Usp29Q9ES63 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
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Usp29Q9ES63 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Usp29Q9ES63 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Usp29Q9ES63 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Usp29Q9ES63 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
Usp29Q9ES63 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Usp29Q9ES63 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Usp29Q9ES63 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Usp29Q9ES63 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Usp29Q9ES63 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Usp29Q9ES63 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Usp29Q9ES63 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Usp29Q9ES63 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Usp29Q9ES63 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Usp29Q9ES63 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
Usp29Q9ES63 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Usp29Q9ES63 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Usp29Q9ES63 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Usp29Q9ES63 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Usp29Q9ES63 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Usp29Q9ES63 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.42
Usp29Q9ES63 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC17.64■□□□□ 0.42
Usp29Q9ES63 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Usp29Q9ES63 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Usp29Q9ES63 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Usp29Q9ES63 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Usp29Q9ES63 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Usp29Q9ES63 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Usp29Q9ES63 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Usp29Q9ES63 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
Usp29Q9ES63 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Usp29Q9ES63 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Usp29Q9ES63 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Usp29Q9ES63 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
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