Protein–RNA interactions for Protein: Q9ERB5

Slco1c1, Solute carrier organic anion transporter family member 1C1, mousemouse

Predictions only

Length 715 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slco1c1Q9ERB5 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Slco1c1Q9ERB5 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Slco1c1Q9ERB5 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Slco1c1Q9ERB5 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Slco1c1Q9ERB5 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Slco1c1Q9ERB5 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Slco1c1Q9ERB5 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Slco1c1Q9ERB5 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Slco1c1Q9ERB5 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Slco1c1Q9ERB5 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Slco1c1Q9ERB5 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Slco1c1Q9ERB5 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Slco1c1Q9ERB5 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Slco1c1Q9ERB5 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Slco1c1Q9ERB5 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Slco1c1Q9ERB5 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Slco1c1Q9ERB5 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Slco1c1Q9ERB5 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Slco1c1Q9ERB5 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Slco1c1Q9ERB5 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Slco1c1Q9ERB5 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Slco1c1Q9ERB5 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Slco1c1Q9ERB5 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Slco1c1Q9ERB5 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Slco1c1Q9ERB5 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Slco1c1Q9ERB5 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Slco1c1Q9ERB5 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Slco1c1Q9ERB5 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Slco1c1Q9ERB5 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Slco1c1Q9ERB5 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Slco1c1Q9ERB5 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Slco1c1Q9ERB5 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Slco1c1Q9ERB5 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Slco1c1Q9ERB5 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Slco1c1Q9ERB5 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Slco1c1Q9ERB5 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Slco1c1Q9ERB5 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Slco1c1Q9ERB5 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Slco1c1Q9ERB5 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Slco1c1Q9ERB5 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Slco1c1Q9ERB5 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Slco1c1Q9ERB5 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Slco1c1Q9ERB5 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Slco1c1Q9ERB5 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Slco1c1Q9ERB5 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Slco1c1Q9ERB5 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Slco1c1Q9ERB5 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Slco1c1Q9ERB5 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Slco1c1Q9ERB5 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Slco1c1Q9ERB5 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Slco1c1Q9ERB5 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Slco1c1Q9ERB5 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Slco1c1Q9ERB5 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Slco1c1Q9ERB5 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Slco1c1Q9ERB5 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Slco1c1Q9ERB5 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Slco1c1Q9ERB5 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Slco1c1Q9ERB5 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Slco1c1Q9ERB5 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Slco1c1Q9ERB5 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Slco1c1Q9ERB5 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Slco1c1Q9ERB5 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Slco1c1Q9ERB5 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Slco1c1Q9ERB5 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Slco1c1Q9ERB5 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Slco1c1Q9ERB5 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Slco1c1Q9ERB5 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Slco1c1Q9ERB5 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Slco1c1Q9ERB5 Fxyd5-208ENSMUST00000161805 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Slco1c1Q9ERB5 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Slco1c1Q9ERB5 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Slco1c1Q9ERB5 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Slco1c1Q9ERB5 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Slco1c1Q9ERB5 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Slco1c1Q9ERB5 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Slco1c1Q9ERB5 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Slco1c1Q9ERB5 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Slco1c1Q9ERB5 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Slco1c1Q9ERB5 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Slco1c1Q9ERB5 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Slco1c1Q9ERB5 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Slco1c1Q9ERB5 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Slco1c1Q9ERB5 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Slco1c1Q9ERB5 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Slco1c1Q9ERB5 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Slco1c1Q9ERB5 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Slco1c1Q9ERB5 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Slco1c1Q9ERB5 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Slco1c1Q9ERB5 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Slco1c1Q9ERB5 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Slco1c1Q9ERB5 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Slco1c1Q9ERB5 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Slco1c1Q9ERB5 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Slco1c1Q9ERB5 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Slco1c1Q9ERB5 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Slco1c1Q9ERB5 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Slco1c1Q9ERB5 1810026B05Rik-205ENSMUST00000184855 409 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Slco1c1Q9ERB5 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Slco1c1Q9ERB5 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Slco1c1Q9ERB5 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 77.5 ms