Protein–RNA interactions for Protein: Q9ER80

Rtp4, Receptor-transporting protein 4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 249 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rtp4Q9ER80 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rtp4Q9ER80 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rtp4Q9ER80 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rtp4Q9ER80 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rtp4Q9ER80 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rtp4Q9ER80 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rtp4Q9ER80 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rtp4Q9ER80 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rtp4Q9ER80 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rtp4Q9ER80 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rtp4Q9ER80 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rtp4Q9ER80 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rtp4Q9ER80 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rtp4Q9ER80 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rtp4Q9ER80 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Rtp4Q9ER80 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rtp4Q9ER80 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rtp4Q9ER80 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rtp4Q9ER80 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rtp4Q9ER80 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rtp4Q9ER80 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rtp4Q9ER80 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rtp4Q9ER80 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rtp4Q9ER80 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rtp4Q9ER80 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rtp4Q9ER80 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rtp4Q9ER80 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rtp4Q9ER80 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rtp4Q9ER80 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rtp4Q9ER80 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Rtp4Q9ER80 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rtp4Q9ER80 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rtp4Q9ER80 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rtp4Q9ER80 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rtp4Q9ER80 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rtp4Q9ER80 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rtp4Q9ER80 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rtp4Q9ER80 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rtp4Q9ER80 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rtp4Q9ER80 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rtp4Q9ER80 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rtp4Q9ER80 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rtp4Q9ER80 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rtp4Q9ER80 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rtp4Q9ER80 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rtp4Q9ER80 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rtp4Q9ER80 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rtp4Q9ER80 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rtp4Q9ER80 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Rtp4Q9ER80 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Rtp4Q9ER80 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Rtp4Q9ER80 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Rtp4Q9ER80 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Rtp4Q9ER80 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rtp4Q9ER80 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rtp4Q9ER80 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rtp4Q9ER80 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rtp4Q9ER80 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rtp4Q9ER80 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rtp4Q9ER80 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rtp4Q9ER80 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rtp4Q9ER80 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rtp4Q9ER80 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rtp4Q9ER80 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rtp4Q9ER80 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rtp4Q9ER80 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rtp4Q9ER80 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rtp4Q9ER80 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rtp4Q9ER80 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rtp4Q9ER80 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rtp4Q9ER80 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rtp4Q9ER80 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rtp4Q9ER80 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rtp4Q9ER80 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rtp4Q9ER80 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rtp4Q9ER80 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Rtp4Q9ER80 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Rtp4Q9ER80 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rtp4Q9ER80 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rtp4Q9ER80 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rtp4Q9ER80 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rtp4Q9ER80 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rtp4Q9ER80 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rtp4Q9ER80 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rtp4Q9ER80 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rtp4Q9ER80 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rtp4Q9ER80 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rtp4Q9ER80 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rtp4Q9ER80 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rtp4Q9ER80 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rtp4Q9ER80 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Rtp4Q9ER80 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Rtp4Q9ER80 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Rtp4Q9ER80 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Rtp4Q9ER80 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Rtp4Q9ER80 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Rtp4Q9ER80 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Rtp4Q9ER80 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rtp4Q9ER80 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rtp4Q9ER80 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.8 ms