Protein–RNA interactions for Protein: Q9ER60

Scn4a, Sodium channel protein type 4 subunit alpha, mousemouse

Predictions only

Length 1,841 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scn4aQ9ER60 Ccdc106-202ENSMUST00000108571 1318 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Scn4aQ9ER60 Gif-201ENSMUST00000025585 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Scn4aQ9ER60 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Scn4aQ9ER60 Iqcd-201ENSMUST00000069259 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Scn4aQ9ER60 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Scn4aQ9ER60 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Scn4aQ9ER60 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Scn4aQ9ER60 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Scn4aQ9ER60 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Scn4aQ9ER60 Khdc3-202ENSMUST00000167514 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Scn4aQ9ER60 Coprs-202ENSMUST00000209371 601 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Scn4aQ9ER60 Apobec2-201ENSMUST00000046549 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Scn4aQ9ER60 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Scn4aQ9ER60 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Scn4aQ9ER60 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Scn4aQ9ER60 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Scn4aQ9ER60 Terf1-201ENSMUST00000027057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Scn4aQ9ER60 Alx1-204ENSMUST00000217946 1542 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Scn4aQ9ER60 Gm6018-201ENSMUST00000216090 1306 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Scn4aQ9ER60 Metrnl-202ENSMUST00000106089 1101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Scn4aQ9ER60 Ndufa5-202ENSMUST00000118558 315 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Scn4aQ9ER60 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Scn4aQ9ER60 Gm15747-202ENSMUST00000151096 524 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Scn4aQ9ER60 Gm20444-201ENSMUST00000174014 648 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Scn4aQ9ER60 Gm5779-201ENSMUST00000218467 910 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Scn4aQ9ER60 Phgr1-201ENSMUST00000061360 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Scn4aQ9ER60 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Scn4aQ9ER60 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Scn4aQ9ER60 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Scn4aQ9ER60 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Scn4aQ9ER60 Ccdc160-201ENSMUST00000101588 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Scn4aQ9ER60 Ftsj1-202ENSMUST00000115594 1529 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Scn4aQ9ER60 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Scn4aQ9ER60 Gm6912-201ENSMUST00000117218 544 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Scn4aQ9ER60 Gm8344-201ENSMUST00000119813 856 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Scn4aQ9ER60 Gm20496-202ENSMUST00000173770 523 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Scn4aQ9ER60 AC087891.2-201ENSMUST00000219293 658 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Scn4aQ9ER60 Gm10188-201ENSMUST00000086544 720 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Scn4aQ9ER60 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Scn4aQ9ER60 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Scn4aQ9ER60 Nphp1-201ENSMUST00000028857 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Scn4aQ9ER60 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Scn4aQ9ER60 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Scn4aQ9ER60 Gm25287-201ENSMUST00000103846 110 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Scn4aQ9ER60 Gm22918-201ENSMUST00000103855 110 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Scn4aQ9ER60 Gm3054-201ENSMUST00000111075 265 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Scn4aQ9ER60 Rerg-203ENSMUST00000119610 890 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Scn4aQ9ER60 Gm27430-201ENSMUST00000184585 107 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Scn4aQ9ER60 1500015A07Rik-203ENSMUST00000184678 890 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Scn4aQ9ER60 Gm44333-201ENSMUST00000197168 107 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Scn4aQ9ER60 Tmem116-202ENSMUST00000060004 1297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Scn4aQ9ER60 Hist1h3c-201ENSMUST00000091752 630 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Scn4aQ9ER60 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Scn4aQ9ER60 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Scn4aQ9ER60 Rnf25-202ENSMUST00000113721 1451 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Scn4aQ9ER60 2810408A11Rik-202ENSMUST00000100969 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Scn4aQ9ER60 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Scn4aQ9ER60 Gm11555-202ENSMUST00000104929 638 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Scn4aQ9ER60 Gm14206-201ENSMUST00000132973 747 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Scn4aQ9ER60 Crem-221ENSMUST00000142690 1256 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Scn4aQ9ER60 Gm24158-201ENSMUST00000175263 71 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Scn4aQ9ER60 Tst-201ENSMUST00000058659 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Scn4aQ9ER60 Gm45844-204ENSMUST00000209833 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Scn4aQ9ER60 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Scn4aQ9ER60 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Scn4aQ9ER60 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Scn4aQ9ER60 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Scn4aQ9ER60 Agpat1-202ENSMUST00000114140 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Scn4aQ9ER60 Agpat1-208ENSMUST00000174595 1911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Scn4aQ9ER60 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Scn4aQ9ER60 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Scn4aQ9ER60 Dph5-204ENSMUST00000189799 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Scn4aQ9ER60 Prg3-201ENSMUST00000028466 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Scn4aQ9ER60 1700080E11Rik-201ENSMUST00000035180 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Scn4aQ9ER60 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Scn4aQ9ER60 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Scn4aQ9ER60 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Scn4aQ9ER60 Sh3bgr-201ENSMUST00000048770 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Scn4aQ9ER60 Gm5069-201ENSMUST00000050581 1328 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Scn4aQ9ER60 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Scn4aQ9ER60 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Scn4aQ9ER60 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Scn4aQ9ER60 Dnajc8-205ENSMUST00000105939 746 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Scn4aQ9ER60 Mrps24-205ENSMUST00000154330 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Scn4aQ9ER60 Gm8239-201ENSMUST00000204094 444 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Scn4aQ9ER60 Gm44855-201ENSMUST00000205725 362 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Scn4aQ9ER60 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Scn4aQ9ER60 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Scn4aQ9ER60 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Scn4aQ9ER60 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Scn4aQ9ER60 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Scn4aQ9ER60 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Scn4aQ9ER60 Nmi-202ENSMUST00000112705 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Scn4aQ9ER60 Trip6-203ENSMUST00000199121 366 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Scn4aQ9ER60 Vmn2r-ps89-201ENSMUST00000209195 1010 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Scn4aQ9ER60 Slc10a7-204ENSMUST00000209992 939 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Scn4aQ9ER60 AC131710.1-201ENSMUST00000228336 990 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Scn4aQ9ER60 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Scn4aQ9ER60 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Scn4aQ9ER60 Gjb3-202ENSMUST00000106091 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.3 ms