Protein–RNA interactions for Protein: Q9EPL5

Mmp1a, Interstitial collagenase A, mousemouse

Predictions only

Length 464 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mmp1aQ9EPL5 Cmtm3-204ENSMUST00000212081 850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Mmp1aQ9EPL5 Timm13-203ENSMUST00000218481 471 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Mmp1aQ9EPL5 Fam159a-201ENSMUST00000053157 593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Mmp1aQ9EPL5 Olfr615-201ENSMUST00000098198 942 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Mmp1aQ9EPL5 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Mmp1aQ9EPL5 Echdc2-201ENSMUST00000052999 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Mmp1aQ9EPL5 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Mmp1aQ9EPL5 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Mmp1aQ9EPL5 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Mmp1aQ9EPL5 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Mmp1aQ9EPL5 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Mmp1aQ9EPL5 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Mmp1aQ9EPL5 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Mmp1aQ9EPL5 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Mmp1aQ9EPL5 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Mmp1aQ9EPL5 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Mmp1aQ9EPL5 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Mmp1aQ9EPL5 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Mmp1aQ9EPL5 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Mmp1aQ9EPL5 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Mmp1aQ9EPL5 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Mmp1aQ9EPL5 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Mmp1aQ9EPL5 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Mmp1aQ9EPL5 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Mmp1aQ9EPL5 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Mmp1aQ9EPL5 Rasd2-201ENSMUST00000132133 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Mmp1aQ9EPL5 Tsc22d1-208ENSMUST00000142683 797 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Mmp1aQ9EPL5 Flg-204ENSMUST00000178752 756 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Mmp1aQ9EPL5 Ndufaf2-202ENSMUST00000223734 556 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Mmp1aQ9EPL5 4921511I17Rik-201ENSMUST00000220545 1341 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Mmp1aQ9EPL5 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Mmp1aQ9EPL5 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Mmp1aQ9EPL5 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Mmp1aQ9EPL5 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Mmp1aQ9EPL5 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Mmp1aQ9EPL5 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Mmp1aQ9EPL5 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Mmp1aQ9EPL5 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Mmp1aQ9EPL5 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Mmp1aQ9EPL5 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Mmp1aQ9EPL5 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Mmp1aQ9EPL5 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Mmp1aQ9EPL5 Gm15706-201ENSMUST00000139612 899 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Mmp1aQ9EPL5 Gm13849-201ENSMUST00000153328 835 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Mmp1aQ9EPL5 Gm8655-201ENSMUST00000221159 852 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Mmp1aQ9EPL5 Gm10175-201ENSMUST00000086013 645 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Mmp1aQ9EPL5 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Mmp1aQ9EPL5 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Mmp1aQ9EPL5 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Mmp1aQ9EPL5 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Mmp1aQ9EPL5 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Mmp1aQ9EPL5 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Mmp1aQ9EPL5 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Mmp1aQ9EPL5 Gm5648-201ENSMUST00000122244 1587 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Mmp1aQ9EPL5 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Mmp1aQ9EPL5 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Mmp1aQ9EPL5 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Mmp1aQ9EPL5 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Mmp1aQ9EPL5 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Mmp1aQ9EPL5 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Mmp1aQ9EPL5 Gm7222-201ENSMUST00000117512 906 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Mmp1aQ9EPL5 Chchd7-203ENSMUST00000119307 889 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Mmp1aQ9EPL5 Frmd5-213ENSMUST00000212518 922 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Mmp1aQ9EPL5 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Mmp1aQ9EPL5 1600017P15Rik-201ENSMUST00000083427 412 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Mmp1aQ9EPL5 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Mmp1aQ9EPL5 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Mmp1aQ9EPL5 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Mmp1aQ9EPL5 Ada-201ENSMUST00000017841 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Mmp1aQ9EPL5 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Mmp1aQ9EPL5 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Mmp1aQ9EPL5 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Mmp1aQ9EPL5 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Mmp1aQ9EPL5 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Mmp1aQ9EPL5 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Mmp1aQ9EPL5 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Mmp1aQ9EPL5 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Mmp1aQ9EPL5 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Mmp1aQ9EPL5 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Mmp1aQ9EPL5 Egfl7-216ENSMUST00000174211 1163 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Mmp1aQ9EPL5 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Mmp1aQ9EPL5 AC084391.1-201ENSMUST00000200651 141 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Mmp1aQ9EPL5 Vsig2-206ENSMUST00000215957 851 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Mmp1aQ9EPL5 Acyp2-201ENSMUST00000074613 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Mmp1aQ9EPL5 Gm3928-201ENSMUST00000121141 1307 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Mmp1aQ9EPL5 1700029H14Rik-203ENSMUST00000134023 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Mmp1aQ9EPL5 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Mmp1aQ9EPL5 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Mmp1aQ9EPL5 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Mmp1aQ9EPL5 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Mmp1aQ9EPL5 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Mmp1aQ9EPL5 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Mmp1aQ9EPL5 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Mmp1aQ9EPL5 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Mmp1aQ9EPL5 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Mmp1aQ9EPL5 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Mmp1aQ9EPL5 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Mmp1aQ9EPL5 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Mmp1aQ9EPL5 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Mmp1aQ9EPL5 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.7 ms