Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBU5

Rnf6, E3 ubiquitin-protein ligase RNF6, mousemouse

Predictions only

Length 667 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf6Q9DBU5 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Rnf6Q9DBU5 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Rnf6Q9DBU5 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Rnf6Q9DBU5 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Rnf6Q9DBU5 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Rnf6Q9DBU5 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Rnf6Q9DBU5 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
Rnf6Q9DBU5 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Rnf6Q9DBU5 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Rnf6Q9DBU5 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
Rnf6Q9DBU5 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Rnf6Q9DBU5 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Rnf6Q9DBU5 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Rnf6Q9DBU5 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Rnf6Q9DBU5 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Rnf6Q9DBU5 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Rnf6Q9DBU5 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Rnf6Q9DBU5 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Rnf6Q9DBU5 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Rnf6Q9DBU5 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Rnf6Q9DBU5 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Rnf6Q9DBU5 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Rnf6Q9DBU5 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Rnf6Q9DBU5 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Rnf6Q9DBU5 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Rnf6Q9DBU5 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Rnf6Q9DBU5 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
Rnf6Q9DBU5 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
Rnf6Q9DBU5 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Rnf6Q9DBU5 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Rnf6Q9DBU5 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Rnf6Q9DBU5 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Rnf6Q9DBU5 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Rnf6Q9DBU5 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Rnf6Q9DBU5 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Rnf6Q9DBU5 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Rnf6Q9DBU5 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Rnf6Q9DBU5 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
Rnf6Q9DBU5 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Rnf6Q9DBU5 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Rnf6Q9DBU5 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Rnf6Q9DBU5 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Rnf6Q9DBU5 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Rnf6Q9DBU5 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Rnf6Q9DBU5 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Rnf6Q9DBU5 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Rnf6Q9DBU5 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Rnf6Q9DBU5 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Rnf6Q9DBU5 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Rnf6Q9DBU5 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Rnf6Q9DBU5 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Rnf6Q9DBU5 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Rnf6Q9DBU5 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Rnf6Q9DBU5 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Rnf6Q9DBU5 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Rnf6Q9DBU5 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Rnf6Q9DBU5 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Rnf6Q9DBU5 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Rnf6Q9DBU5 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Rnf6Q9DBU5 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Rnf6Q9DBU5 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Rnf6Q9DBU5 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Rnf6Q9DBU5 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Rnf6Q9DBU5 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Rnf6Q9DBU5 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Rnf6Q9DBU5 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Rnf6Q9DBU5 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Rnf6Q9DBU5 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Rnf6Q9DBU5 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Rnf6Q9DBU5 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Rnf6Q9DBU5 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Rnf6Q9DBU5 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Rnf6Q9DBU5 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Rnf6Q9DBU5 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Rnf6Q9DBU5 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Rnf6Q9DBU5 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Rnf6Q9DBU5 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Rnf6Q9DBU5 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Rnf6Q9DBU5 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Rnf6Q9DBU5 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Rnf6Q9DBU5 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Rnf6Q9DBU5 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Rnf6Q9DBU5 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Rnf6Q9DBU5 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Rnf6Q9DBU5 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Rnf6Q9DBU5 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Rnf6Q9DBU5 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Rnf6Q9DBU5 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Rnf6Q9DBU5 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Rnf6Q9DBU5 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Rnf6Q9DBU5 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Rnf6Q9DBU5 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Rnf6Q9DBU5 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Rnf6Q9DBU5 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Rnf6Q9DBU5 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Rnf6Q9DBU5 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Rnf6Q9DBU5 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Rnf6Q9DBU5 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Rnf6Q9DBU5 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Rnf6Q9DBU5 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.8 ms