Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBT3

Ccdc97, Coiled-coil domain-containing protein 97, mousemouse

Predictions only

Length 340 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc97Q9DBT3 Tbx3os1-206ENSMUST00000202307 1787 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccdc97Q9DBT3 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccdc97Q9DBT3 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccdc97Q9DBT3 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccdc97Q9DBT3 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccdc97Q9DBT3 Dlg5-203ENSMUST00000090398 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccdc97Q9DBT3 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccdc97Q9DBT3 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccdc97Q9DBT3 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccdc97Q9DBT3 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ccdc97Q9DBT3 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ccdc97Q9DBT3 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ccdc97Q9DBT3 Glg1-204ENSMUST00000169020 7021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ccdc97Q9DBT3 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ccdc97Q9DBT3 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ccdc97Q9DBT3 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ccdc97Q9DBT3 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ccdc97Q9DBT3 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ccdc97Q9DBT3 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ccdc97Q9DBT3 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Ccdc97Q9DBT3 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ccdc97Q9DBT3 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ccdc97Q9DBT3 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ccdc97Q9DBT3 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ccdc97Q9DBT3 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ccdc97Q9DBT3 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ccdc97Q9DBT3 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Ccdc97Q9DBT3 Mapk8ip1-202ENSMUST00000111279 3274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ccdc97Q9DBT3 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ccdc97Q9DBT3 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ccdc97Q9DBT3 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ccdc97Q9DBT3 Ush1g-201ENSMUST00000103037 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ccdc97Q9DBT3 Espnl-202ENSMUST00000176156 2886 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ccdc97Q9DBT3 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ccdc97Q9DBT3 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ccdc97Q9DBT3 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ccdc97Q9DBT3 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ccdc97Q9DBT3 Ubn1-201ENSMUST00000052449 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ccdc97Q9DBT3 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ccdc97Q9DBT3 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ccdc97Q9DBT3 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Ccdc97Q9DBT3 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Ccdc97Q9DBT3 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Ccdc97Q9DBT3 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ccdc97Q9DBT3 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ccdc97Q9DBT3 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ccdc97Q9DBT3 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ccdc97Q9DBT3 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ccdc97Q9DBT3 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ccdc97Q9DBT3 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ccdc97Q9DBT3 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ccdc97Q9DBT3 Syt3-201ENSMUST00000118831 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ccdc97Q9DBT3 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ccdc97Q9DBT3 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Ccdc97Q9DBT3 Timp2-201ENSMUST00000017610 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ccdc97Q9DBT3 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Ccdc97Q9DBT3 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccdc97Q9DBT3 Nell1-201ENSMUST00000081872 6617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccdc97Q9DBT3 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccdc97Q9DBT3 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccdc97Q9DBT3 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccdc97Q9DBT3 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccdc97Q9DBT3 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccdc97Q9DBT3 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccdc97Q9DBT3 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccdc97Q9DBT3 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccdc97Q9DBT3 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccdc97Q9DBT3 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccdc97Q9DBT3 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccdc97Q9DBT3 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccdc97Q9DBT3 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccdc97Q9DBT3 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccdc97Q9DBT3 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccdc97Q9DBT3 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccdc97Q9DBT3 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccdc97Q9DBT3 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccdc97Q9DBT3 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccdc97Q9DBT3 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccdc97Q9DBT3 Ttll3-201ENSMUST00000032414 3168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccdc97Q9DBT3 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccdc97Q9DBT3 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccdc97Q9DBT3 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Ccdc97Q9DBT3 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ccdc97Q9DBT3 Ralbp1-201ENSMUST00000024905 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ccdc97Q9DBT3 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ccdc97Q9DBT3 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ccdc97Q9DBT3 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ccdc97Q9DBT3 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ccdc97Q9DBT3 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ccdc97Q9DBT3 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Ccdc97Q9DBT3 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Ccdc97Q9DBT3 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ccdc97Q9DBT3 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ccdc97Q9DBT3 Gm44443-201ENSMUST00000204396 5633 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Ccdc97Q9DBT3 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ccdc97Q9DBT3 Cacnb4-201ENSMUST00000078324 8225 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ccdc97Q9DBT3 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ccdc97Q9DBT3 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ccdc97Q9DBT3 Nipal2-201ENSMUST00000040791 4331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ccdc97Q9DBT3 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22 ms