Protein–RNA interactions for Protein: Q9DA73

Ccdc89, Coiled-coil domain-containing protein 89, mousemouse

Predictions only

Length 370 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc89Q9DA73 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccdc89Q9DA73 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccdc89Q9DA73 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccdc89Q9DA73 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccdc89Q9DA73 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccdc89Q9DA73 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccdc89Q9DA73 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccdc89Q9DA73 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccdc89Q9DA73 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccdc89Q9DA73 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccdc89Q9DA73 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccdc89Q9DA73 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccdc89Q9DA73 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccdc89Q9DA73 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccdc89Q9DA73 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccdc89Q9DA73 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccdc89Q9DA73 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccdc89Q9DA73 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccdc89Q9DA73 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccdc89Q9DA73 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccdc89Q9DA73 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccdc89Q9DA73 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccdc89Q9DA73 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccdc89Q9DA73 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccdc89Q9DA73 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccdc89Q9DA73 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccdc89Q9DA73 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccdc89Q9DA73 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccdc89Q9DA73 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ccdc89Q9DA73 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ccdc89Q9DA73 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ccdc89Q9DA73 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ccdc89Q9DA73 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ccdc89Q9DA73 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ccdc89Q9DA73 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Ccdc89Q9DA73 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ccdc89Q9DA73 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ccdc89Q9DA73 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ccdc89Q9DA73 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Ccdc89Q9DA73 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ccdc89Q9DA73 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ccdc89Q9DA73 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ccdc89Q9DA73 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ccdc89Q9DA73 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ccdc89Q9DA73 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ccdc89Q9DA73 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ccdc89Q9DA73 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ccdc89Q9DA73 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ccdc89Q9DA73 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ccdc89Q9DA73 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ccdc89Q9DA73 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ccdc89Q9DA73 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ccdc89Q9DA73 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ccdc89Q9DA73 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ccdc89Q9DA73 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ccdc89Q9DA73 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ccdc89Q9DA73 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ccdc89Q9DA73 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ccdc89Q9DA73 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ccdc89Q9DA73 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ccdc89Q9DA73 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ccdc89Q9DA73 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Ccdc89Q9DA73 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ccdc89Q9DA73 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Ccdc89Q9DA73 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ccdc89Q9DA73 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ccdc89Q9DA73 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ccdc89Q9DA73 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ccdc89Q9DA73 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ccdc89Q9DA73 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ccdc89Q9DA73 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ccdc89Q9DA73 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ccdc89Q9DA73 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ccdc89Q9DA73 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ccdc89Q9DA73 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
Ccdc89Q9DA73 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
Ccdc89Q9DA73 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ccdc89Q9DA73 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ccdc89Q9DA73 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ccdc89Q9DA73 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ccdc89Q9DA73 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ccdc89Q9DA73 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ccdc89Q9DA73 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ccdc89Q9DA73 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ccdc89Q9DA73 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ccdc89Q9DA73 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ccdc89Q9DA73 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ccdc89Q9DA73 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ccdc89Q9DA73 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ccdc89Q9DA73 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ccdc89Q9DA73 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ccdc89Q9DA73 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ccdc89Q9DA73 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ccdc89Q9DA73 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ccdc89Q9DA73 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ccdc89Q9DA73 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ccdc89Q9DA73 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ccdc89Q9DA73 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ccdc89Q9DA73 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ccdc89Q9DA73 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.5 ms