Protein–RNA interactions for Protein: Q9DA21

Smco2, Single-pass membrane and coiled-coil domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 347 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smco2Q9DA21 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Smco2Q9DA21 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Smco2Q9DA21 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Smco2Q9DA21 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Smco2Q9DA21 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Smco2Q9DA21 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Smco2Q9DA21 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Smco2Q9DA21 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Smco2Q9DA21 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Smco2Q9DA21 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Smco2Q9DA21 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Smco2Q9DA21 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Smco2Q9DA21 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Smco2Q9DA21 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Smco2Q9DA21 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Smco2Q9DA21 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Smco2Q9DA21 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Smco2Q9DA21 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Smco2Q9DA21 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Smco2Q9DA21 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Smco2Q9DA21 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Smco2Q9DA21 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Smco2Q9DA21 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Smco2Q9DA21 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Smco2Q9DA21 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Smco2Q9DA21 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Smco2Q9DA21 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Smco2Q9DA21 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Smco2Q9DA21 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Smco2Q9DA21 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Smco2Q9DA21 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Smco2Q9DA21 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Smco2Q9DA21 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Smco2Q9DA21 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Smco2Q9DA21 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Smco2Q9DA21 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Smco2Q9DA21 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Smco2Q9DA21 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Smco2Q9DA21 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Smco2Q9DA21 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Smco2Q9DA21 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Smco2Q9DA21 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Smco2Q9DA21 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Smco2Q9DA21 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Smco2Q9DA21 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Smco2Q9DA21 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Smco2Q9DA21 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Smco2Q9DA21 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Smco2Q9DA21 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Smco2Q9DA21 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Smco2Q9DA21 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Smco2Q9DA21 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Smco2Q9DA21 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Smco2Q9DA21 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Smco2Q9DA21 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Smco2Q9DA21 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Smco2Q9DA21 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Smco2Q9DA21 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Smco2Q9DA21 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Smco2Q9DA21 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Smco2Q9DA21 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Smco2Q9DA21 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Smco2Q9DA21 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Smco2Q9DA21 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Smco2Q9DA21 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Smco2Q9DA21 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Smco2Q9DA21 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Smco2Q9DA21 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Smco2Q9DA21 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Smco2Q9DA21 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Smco2Q9DA21 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Smco2Q9DA21 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Smco2Q9DA21 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Smco2Q9DA21 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Smco2Q9DA21 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Smco2Q9DA21 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Smco2Q9DA21 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Smco2Q9DA21 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Smco2Q9DA21 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Smco2Q9DA21 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Smco2Q9DA21 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Smco2Q9DA21 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Smco2Q9DA21 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Smco2Q9DA21 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Smco2Q9DA21 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Smco2Q9DA21 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Smco2Q9DA21 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Smco2Q9DA21 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Smco2Q9DA21 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Smco2Q9DA21 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Smco2Q9DA21 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Smco2Q9DA21 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Smco2Q9DA21 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Smco2Q9DA21 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Smco2Q9DA21 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Smco2Q9DA21 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Smco2Q9DA21 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Smco2Q9DA21 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Smco2Q9DA21 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Smco2Q9DA21 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.1 ms