Protein–RNA interactions for Protein: Q9D9M2

Usp12, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 12, mousemouse

Predictions only

Length 370 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp12Q9D9M2 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Usp12Q9D9M2 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Usp12Q9D9M2 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Usp12Q9D9M2 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Usp12Q9D9M2 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Usp12Q9D9M2 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Usp12Q9D9M2 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Usp12Q9D9M2 Rpl19-ps10-201ENSMUST00000205555 330 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Usp12Q9D9M2 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Usp12Q9D9M2 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Usp12Q9D9M2 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Usp12Q9D9M2 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Usp12Q9D9M2 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Usp12Q9D9M2 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Usp12Q9D9M2 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Usp12Q9D9M2 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Usp12Q9D9M2 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Usp12Q9D9M2 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Usp12Q9D9M2 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Usp12Q9D9M2 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Usp12Q9D9M2 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Usp12Q9D9M2 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Usp12Q9D9M2 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Usp12Q9D9M2 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Usp12Q9D9M2 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Usp12Q9D9M2 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Usp12Q9D9M2 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Usp12Q9D9M2 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Usp12Q9D9M2 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Usp12Q9D9M2 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Usp12Q9D9M2 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Usp12Q9D9M2 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Usp12Q9D9M2 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Usp12Q9D9M2 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Usp12Q9D9M2 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Usp12Q9D9M2 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Usp12Q9D9M2 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Usp12Q9D9M2 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Usp12Q9D9M2 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Usp12Q9D9M2 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Usp12Q9D9M2 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Usp12Q9D9M2 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Usp12Q9D9M2 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Usp12Q9D9M2 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Usp12Q9D9M2 Slc19a2-204ENSMUST00000169394 894 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Usp12Q9D9M2 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Usp12Q9D9M2 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Usp12Q9D9M2 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Usp12Q9D9M2 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Usp12Q9D9M2 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Usp12Q9D9M2 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Usp12Q9D9M2 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Usp12Q9D9M2 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Usp12Q9D9M2 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Usp12Q9D9M2 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Usp12Q9D9M2 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Usp12Q9D9M2 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Usp12Q9D9M2 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Usp12Q9D9M2 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Usp12Q9D9M2 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Usp12Q9D9M2 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Usp12Q9D9M2 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Usp12Q9D9M2 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Usp12Q9D9M2 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Usp12Q9D9M2 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Usp12Q9D9M2 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Usp12Q9D9M2 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Usp12Q9D9M2 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Usp12Q9D9M2 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Usp12Q9D9M2 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Usp12Q9D9M2 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Usp12Q9D9M2 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Usp12Q9D9M2 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Usp12Q9D9M2 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Usp12Q9D9M2 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Usp12Q9D9M2 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Usp12Q9D9M2 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Usp12Q9D9M2 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Usp12Q9D9M2 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Usp12Q9D9M2 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Usp12Q9D9M2 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Usp12Q9D9M2 Gm26661-201ENSMUST00000181025 471 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Usp12Q9D9M2 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Usp12Q9D9M2 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Usp12Q9D9M2 Shisa5-218ENSMUST00000200515 1005 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Usp12Q9D9M2 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Usp12Q9D9M2 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Usp12Q9D9M2 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Usp12Q9D9M2 Idnk-201ENSMUST00000051490 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Usp12Q9D9M2 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Usp12Q9D9M2 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Usp12Q9D9M2 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Usp12Q9D9M2 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Usp12Q9D9M2 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Usp12Q9D9M2 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Usp12Q9D9M2 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Usp12Q9D9M2 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Usp12Q9D9M2 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Usp12Q9D9M2 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Usp12Q9D9M2 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.2 ms