Protein–RNA interactions for Protein: Q9D9J3

Actrt1, Actin-related protein T1, mousemouse

Predictions only

Length 376 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Actrt1Q9D9J3 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Actrt1Q9D9J3 Irf3-201ENSMUST00000003284 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Actrt1Q9D9J3 Fam167a-201ENSMUST00000121288 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Actrt1Q9D9J3 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Actrt1Q9D9J3 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Actrt1Q9D9J3 Eif4g1-201ENSMUST00000044783 5444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Actrt1Q9D9J3 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Actrt1Q9D9J3 Xylt2-201ENSMUST00000116349 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Actrt1Q9D9J3 Tesk2-203ENSMUST00000106459 2444 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Actrt1Q9D9J3 Flywch1-202ENSMUST00000086325 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Actrt1Q9D9J3 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Actrt1Q9D9J3 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Actrt1Q9D9J3 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Actrt1Q9D9J3 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Actrt1Q9D9J3 Mcidas-201ENSMUST00000092089 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Actrt1Q9D9J3 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Actrt1Q9D9J3 Daxx-201ENSMUST00000079421 2580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Actrt1Q9D9J3 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Actrt1Q9D9J3 Rdx-201ENSMUST00000000590 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Actrt1Q9D9J3 Sbno2-204ENSMUST00000217972 2462 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Actrt1Q9D9J3 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Actrt1Q9D9J3 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Actrt1Q9D9J3 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Actrt1Q9D9J3 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Actrt1Q9D9J3 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Actrt1Q9D9J3 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Actrt1Q9D9J3 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Actrt1Q9D9J3 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Actrt1Q9D9J3 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Actrt1Q9D9J3 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Actrt1Q9D9J3 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Actrt1Q9D9J3 Vwa5b2-203ENSMUST00000100074 2512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Actrt1Q9D9J3 Gm39027-201ENSMUST00000208560 2942 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Actrt1Q9D9J3 Stard5-201ENSMUST00000075418 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Actrt1Q9D9J3 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Actrt1Q9D9J3 Steap2-202ENSMUST00000115424 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Actrt1Q9D9J3 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Actrt1Q9D9J3 Nat8f7-201ENSMUST00000160534 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Actrt1Q9D9J3 Hsp90b1-201ENSMUST00000020238 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Actrt1Q9D9J3 Slc4a5-203ENSMUST00000113900 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Actrt1Q9D9J3 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Actrt1Q9D9J3 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Actrt1Q9D9J3 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Actrt1Q9D9J3 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Actrt1Q9D9J3 Zfp36-202ENSMUST00000209061 2465 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Actrt1Q9D9J3 Efcab14-202ENSMUST00000106522 2636 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Actrt1Q9D9J3 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Actrt1Q9D9J3 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Actrt1Q9D9J3 Ttc13-210ENSMUST00000214828 3301 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Actrt1Q9D9J3 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Actrt1Q9D9J3 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Actrt1Q9D9J3 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Actrt1Q9D9J3 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Actrt1Q9D9J3 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Actrt1Q9D9J3 Tpbg-201ENSMUST00000006559 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Actrt1Q9D9J3 Rfx5-207ENSMUST00000137088 4333 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Actrt1Q9D9J3 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Actrt1Q9D9J3 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Actrt1Q9D9J3 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Actrt1Q9D9J3 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Actrt1Q9D9J3 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Actrt1Q9D9J3 Rhoj-202ENSMUST00000118602 2396 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Actrt1Q9D9J3 Ncf1-205ENSMUST00000144086 2882 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Actrt1Q9D9J3 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Actrt1Q9D9J3 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Actrt1Q9D9J3 Slc30a5-201ENSMUST00000067246 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Actrt1Q9D9J3 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Actrt1Q9D9J3 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Actrt1Q9D9J3 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Actrt1Q9D9J3 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Actrt1Q9D9J3 Gm29340-201ENSMUST00000188763 3854 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Actrt1Q9D9J3 Prdm4-201ENSMUST00000037646 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Actrt1Q9D9J3 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Actrt1Q9D9J3 Gm10676-201ENSMUST00000098778 3221 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Actrt1Q9D9J3 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Actrt1Q9D9J3 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Actrt1Q9D9J3 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Actrt1Q9D9J3 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Actrt1Q9D9J3 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Actrt1Q9D9J3 Repin1-207ENSMUST00000163452 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Actrt1Q9D9J3 Muc3a-201ENSMUST00000179412 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Actrt1Q9D9J3 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Actrt1Q9D9J3 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Actrt1Q9D9J3 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Actrt1Q9D9J3 Gm5934-201ENSMUST00000120734 2588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Actrt1Q9D9J3 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Actrt1Q9D9J3 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Actrt1Q9D9J3 Ccna2-201ENSMUST00000029270 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Actrt1Q9D9J3 Tnfaip8l1-201ENSMUST00000077788 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Actrt1Q9D9J3 Fam71a-201ENSMUST00000171798 2234 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Actrt1Q9D9J3 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Actrt1Q9D9J3 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Actrt1Q9D9J3 Fdx1-202ENSMUST00000214013 2759 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Actrt1Q9D9J3 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Actrt1Q9D9J3 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Actrt1Q9D9J3 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Actrt1Q9D9J3 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Actrt1Q9D9J3 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Actrt1Q9D9J3 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Actrt1Q9D9J3 6430573F11Rik-205ENSMUST00000171777 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.5 ms