Protein–RNA interactions for Protein: Q9D906

Atg7, Ubiquitin-like modifier-activating enzyme ATG7, mousemouse

Predictions only

Length 698 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg7Q9D906 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Atg7Q9D906 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Atg7Q9D906 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Atg7Q9D906 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Atg7Q9D906 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Atg7Q9D906 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Atg7Q9D906 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Atg7Q9D906 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Atg7Q9D906 Eapp-203ENSMUST00000160085 676 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Atg7Q9D906 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Atg7Q9D906 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Atg7Q9D906 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Atg7Q9D906 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Atg7Q9D906 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Atg7Q9D906 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Atg7Q9D906 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Atg7Q9D906 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Atg7Q9D906 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Atg7Q9D906 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Atg7Q9D906 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Atg7Q9D906 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Atg7Q9D906 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Atg7Q9D906 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Atg7Q9D906 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Atg7Q9D906 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Atg7Q9D906 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Atg7Q9D906 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Atg7Q9D906 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Atg7Q9D906 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Atg7Q9D906 Lce3c-201ENSMUST00000055375 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Atg7Q9D906 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Atg7Q9D906 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Atg7Q9D906 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Atg7Q9D906 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Atg7Q9D906 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Atg7Q9D906 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Atg7Q9D906 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Atg7Q9D906 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Atg7Q9D906 Tsen15-201ENSMUST00000015124 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Atg7Q9D906 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Atg7Q9D906 H2-T-ps-201ENSMUST00000172538 1067 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Atg7Q9D906 Gm33054-201ENSMUST00000216588 313 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Atg7Q9D906 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Atg7Q9D906 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Atg7Q9D906 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Atg7Q9D906 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Atg7Q9D906 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Atg7Q9D906 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Atg7Q9D906 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Atg7Q9D906 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Atg7Q9D906 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Atg7Q9D906 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Atg7Q9D906 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Atg7Q9D906 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Atg7Q9D906 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Atg7Q9D906 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Atg7Q9D906 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Atg7Q9D906 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Atg7Q9D906 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Atg7Q9D906 Tmem255b-201ENSMUST00000167071 1138 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Atg7Q9D906 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Atg7Q9D906 Gm18195-201ENSMUST00000207604 706 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Atg7Q9D906 Hmgb1-rs17-201ENSMUST00000210634 972 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Atg7Q9D906 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Atg7Q9D906 Rps4l-201ENSMUST00000071745 943 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Atg7Q9D906 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Atg7Q9D906 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Atg7Q9D906 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Atg7Q9D906 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Atg7Q9D906 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Atg7Q9D906 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Atg7Q9D906 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Atg7Q9D906 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Atg7Q9D906 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Atg7Q9D906 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Atg7Q9D906 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Atg7Q9D906 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Atg7Q9D906 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Atg7Q9D906 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Atg7Q9D906 Gm13830-205ENSMUST00000201195 1155 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Atg7Q9D906 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Atg7Q9D906 Bpifa3-201ENSMUST00000028984 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Atg7Q9D906 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Atg7Q9D906 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Atg7Q9D906 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Atg7Q9D906 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Atg7Q9D906 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Atg7Q9D906 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Atg7Q9D906 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Atg7Q9D906 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Atg7Q9D906 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Atg7Q9D906 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Atg7Q9D906 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Atg7Q9D906 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Atg7Q9D906 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Atg7Q9D906 Hnrnpa1l2-ps-201ENSMUST00000129154 964 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Atg7Q9D906 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Atg7Q9D906 Tnnt2-207ENSMUST00000179863 1097 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Atg7Q9D906 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Atg7Q9D906 Tnnt2-209ENSMUST00000188028 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.6 ms