Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8P4

Mrpl17, 39S ribosomal protein L17, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 176 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mrpl17Q9D8P4 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Mrpl17Q9D8P4 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Mrpl17Q9D8P4 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Mrpl17Q9D8P4 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Mrpl17Q9D8P4 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Mrpl17Q9D8P4 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Mrpl17Q9D8P4 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Mrpl17Q9D8P4 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Mrpl17Q9D8P4 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Mrpl17Q9D8P4 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Mrpl17Q9D8P4 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Mrpl17Q9D8P4 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Mrpl17Q9D8P4 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Mrpl17Q9D8P4 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Mrpl17Q9D8P4 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Mrpl17Q9D8P4 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Mrpl17Q9D8P4 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Mrpl17Q9D8P4 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Mrpl17Q9D8P4 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Mrpl17Q9D8P4 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Mrpl17Q9D8P4 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Mrpl17Q9D8P4 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Mrpl17Q9D8P4 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Mrpl17Q9D8P4 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Mrpl17Q9D8P4 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Mrpl17Q9D8P4 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Mrpl17Q9D8P4 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Mrpl17Q9D8P4 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Mrpl17Q9D8P4 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Mrpl17Q9D8P4 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Mrpl17Q9D8P4 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Mrpl17Q9D8P4 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Mrpl17Q9D8P4 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Mrpl17Q9D8P4 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Mrpl17Q9D8P4 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Mrpl17Q9D8P4 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Mrpl17Q9D8P4 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Mrpl17Q9D8P4 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Mrpl17Q9D8P4 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Mrpl17Q9D8P4 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Mrpl17Q9D8P4 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Mrpl17Q9D8P4 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Mrpl17Q9D8P4 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Mrpl17Q9D8P4 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Mrpl17Q9D8P4 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Mrpl17Q9D8P4 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Mrpl17Q9D8P4 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Mrpl17Q9D8P4 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Mrpl17Q9D8P4 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Mrpl17Q9D8P4 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Mrpl17Q9D8P4 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Mrpl17Q9D8P4 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Mrpl17Q9D8P4 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Mrpl17Q9D8P4 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Mrpl17Q9D8P4 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Mrpl17Q9D8P4 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Mrpl17Q9D8P4 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Mrpl17Q9D8P4 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Mrpl17Q9D8P4 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Mrpl17Q9D8P4 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Mrpl17Q9D8P4 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Mrpl17Q9D8P4 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Mrpl17Q9D8P4 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Mrpl17Q9D8P4 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Mrpl17Q9D8P4 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Mrpl17Q9D8P4 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Mrpl17Q9D8P4 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Mrpl17Q9D8P4 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Mrpl17Q9D8P4 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Mrpl17Q9D8P4 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Mrpl17Q9D8P4 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Mrpl17Q9D8P4 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Mrpl17Q9D8P4 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Mrpl17Q9D8P4 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Mrpl17Q9D8P4 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Mrpl17Q9D8P4 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Mrpl17Q9D8P4 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Mrpl17Q9D8P4 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Mrpl17Q9D8P4 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Mrpl17Q9D8P4 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Mrpl17Q9D8P4 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Mrpl17Q9D8P4 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Mrpl17Q9D8P4 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Mrpl17Q9D8P4 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Mrpl17Q9D8P4 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Mrpl17Q9D8P4 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Mrpl17Q9D8P4 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Mrpl17Q9D8P4 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Mrpl17Q9D8P4 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Mrpl17Q9D8P4 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Mrpl17Q9D8P4 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Mrpl17Q9D8P4 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Mrpl17Q9D8P4 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Mrpl17Q9D8P4 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Mrpl17Q9D8P4 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Mrpl17Q9D8P4 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Mrpl17Q9D8P4 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Mrpl17Q9D8P4 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Mrpl17Q9D8P4 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Mrpl17Q9D8P4 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.9 ms