Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7V1

Sh2d4a, SH2 domain-containing protein 4A, mousemouse

Predictions only

Length 421 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh2d4aQ9D7V1 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sh2d4aQ9D7V1 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Sh2d4aQ9D7V1 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sh2d4aQ9D7V1 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sh2d4aQ9D7V1 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sh2d4aQ9D7V1 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sh2d4aQ9D7V1 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sh2d4aQ9D7V1 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sh2d4aQ9D7V1 Bag4-201ENSMUST00000038498 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sh2d4aQ9D7V1 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sh2d4aQ9D7V1 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sh2d4aQ9D7V1 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sh2d4aQ9D7V1 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sh2d4aQ9D7V1 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sh2d4aQ9D7V1 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sh2d4aQ9D7V1 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sh2d4aQ9D7V1 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sh2d4aQ9D7V1 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sh2d4aQ9D7V1 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sh2d4aQ9D7V1 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sh2d4aQ9D7V1 Anks1-203ENSMUST00000114842 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sh2d4aQ9D7V1 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sh2d4aQ9D7V1 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sh2d4aQ9D7V1 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sh2d4aQ9D7V1 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sh2d4aQ9D7V1 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sh2d4aQ9D7V1 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sh2d4aQ9D7V1 Hnrnpul1-205ENSMUST00000206832 3784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sh2d4aQ9D7V1 Slc4a7-201ENSMUST00000057015 8132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sh2d4aQ9D7V1 AC013548.1-201ENSMUST00000228850 4738 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sh2d4aQ9D7V1 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sh2d4aQ9D7V1 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sh2d4aQ9D7V1 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sh2d4aQ9D7V1 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sh2d4aQ9D7V1 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sh2d4aQ9D7V1 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sh2d4aQ9D7V1 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sh2d4aQ9D7V1 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sh2d4aQ9D7V1 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sh2d4aQ9D7V1 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sh2d4aQ9D7V1 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sh2d4aQ9D7V1 Nipal2-201ENSMUST00000040791 4331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sh2d4aQ9D7V1 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sh2d4aQ9D7V1 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Sh2d4aQ9D7V1 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sh2d4aQ9D7V1 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sh2d4aQ9D7V1 Plcb1-205ENSMUST00000131552 7202 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sh2d4aQ9D7V1 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sh2d4aQ9D7V1 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sh2d4aQ9D7V1 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sh2d4aQ9D7V1 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sh2d4aQ9D7V1 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sh2d4aQ9D7V1 Socs7-201ENSMUST00000045540 7015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sh2d4aQ9D7V1 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sh2d4aQ9D7V1 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sh2d4aQ9D7V1 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sh2d4aQ9D7V1 Edem3-201ENSMUST00000059498 6327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sh2d4aQ9D7V1 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sh2d4aQ9D7V1 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sh2d4aQ9D7V1 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sh2d4aQ9D7V1 Usp53-201ENSMUST00000090379 6185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sh2d4aQ9D7V1 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sh2d4aQ9D7V1 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sh2d4aQ9D7V1 Kmt5b-208ENSMUST00000113977 6002 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sh2d4aQ9D7V1 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sh2d4aQ9D7V1 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sh2d4aQ9D7V1 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sh2d4aQ9D7V1 Pank3-201ENSMUST00000018990 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sh2d4aQ9D7V1 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sh2d4aQ9D7V1 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sh2d4aQ9D7V1 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sh2d4aQ9D7V1 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sh2d4aQ9D7V1 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sh2d4aQ9D7V1 Arhgef12-202ENSMUST00000165665 10752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sh2d4aQ9D7V1 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sh2d4aQ9D7V1 Tle3-205ENSMUST00000159630 4065 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sh2d4aQ9D7V1 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sh2d4aQ9D7V1 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sh2d4aQ9D7V1 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sh2d4aQ9D7V1 Naa15-201ENSMUST00000029303 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sh2d4aQ9D7V1 Bri3bp-201ENSMUST00000049040 6473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sh2d4aQ9D7V1 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sh2d4aQ9D7V1 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sh2d4aQ9D7V1 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sh2d4aQ9D7V1 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sh2d4aQ9D7V1 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sh2d4aQ9D7V1 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sh2d4aQ9D7V1 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sh2d4aQ9D7V1 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Sh2d4aQ9D7V1 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sh2d4aQ9D7V1 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sh2d4aQ9D7V1 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sh2d4aQ9D7V1 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sh2d4aQ9D7V1 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sh2d4aQ9D7V1 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sh2d4aQ9D7V1 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sh2d4aQ9D7V1 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sh2d4aQ9D7V1 Malt1-201ENSMUST00000049248 5073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sh2d4aQ9D7V1 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sh2d4aQ9D7V1 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.5 ms