Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7D7

Cldn23, Claudin-23, mousemouse

Predictions only

Length 296 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn23Q9D7D7 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Cldn23Q9D7D7 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Cldn23Q9D7D7 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Cldn23Q9D7D7 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Cldn23Q9D7D7 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Cldn23Q9D7D7 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC13.9□□□□□ -0.19
Cldn23Q9D7D7 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Cldn23Q9D7D7 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Cldn23Q9D7D7 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Cldn23Q9D7D7 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Cldn23Q9D7D7 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Cldn23Q9D7D7 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Cldn23Q9D7D7 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Cldn23Q9D7D7 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Cldn23Q9D7D7 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Cldn23Q9D7D7 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Cldn23Q9D7D7 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Cldn23Q9D7D7 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Cldn23Q9D7D7 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Cldn23Q9D7D7 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Cldn23Q9D7D7 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Cldn23Q9D7D7 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Cldn23Q9D7D7 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Cldn23Q9D7D7 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Cldn23Q9D7D7 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Cldn23Q9D7D7 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Cldn23Q9D7D7 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Cldn23Q9D7D7 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Cldn23Q9D7D7 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Cldn23Q9D7D7 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Cldn23Q9D7D7 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Cldn23Q9D7D7 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Cldn23Q9D7D7 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Cldn23Q9D7D7 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Cldn23Q9D7D7 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
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Cldn23Q9D7D7 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Cldn23Q9D7D7 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Cldn23Q9D7D7 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Cldn23Q9D7D7 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Cldn23Q9D7D7 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Cldn23Q9D7D7 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
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Cldn23Q9D7D7 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Cldn23Q9D7D7 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Cldn23Q9D7D7 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Cldn23Q9D7D7 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
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Cldn23Q9D7D7 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Cldn23Q9D7D7 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Cldn23Q9D7D7 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
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Cldn23Q9D7D7 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Cldn23Q9D7D7 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Cldn23Q9D7D7 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Cldn23Q9D7D7 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Cldn23Q9D7D7 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Cldn23Q9D7D7 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Cldn23Q9D7D7 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
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Cldn23Q9D7D7 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
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Cldn23Q9D7D7 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Cldn23Q9D7D7 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Cldn23Q9D7D7 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Cldn23Q9D7D7 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Cldn23Q9D7D7 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Cldn23Q9D7D7 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Cldn23Q9D7D7 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Cldn23Q9D7D7 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Cldn23Q9D7D7 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
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Cldn23Q9D7D7 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Cldn23Q9D7D7 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Cldn23Q9D7D7 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
Cldn23Q9D7D7 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Cldn23Q9D7D7 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Cldn23Q9D7D7 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Cldn23Q9D7D7 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
Cldn23Q9D7D7 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Cldn23Q9D7D7 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Cldn23Q9D7D7 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Cldn23Q9D7D7 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Cldn23Q9D7D7 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Cldn23Q9D7D7 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Cldn23Q9D7D7 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Cldn23Q9D7D7 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Cldn23Q9D7D7 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Cldn23Q9D7D7 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Cldn23Q9D7D7 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Cldn23Q9D7D7 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Cldn23Q9D7D7 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Cldn23Q9D7D7 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Cldn23Q9D7D7 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Cldn23Q9D7D7 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
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