Protein–RNA interactions for Protein: Q9D6Y7

Msra, Mitochondrial peptide methionine sulfoxide reductase, mousemouse

Predictions only

Length 233 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MsraQ9D6Y7 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
MsraQ9D6Y7 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
MsraQ9D6Y7 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
MsraQ9D6Y7 Gm11508-201ENSMUST00000129337 440 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
MsraQ9D6Y7 0610025J13Rik-201ENSMUST00000131324 652 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
MsraQ9D6Y7 AA465934-202ENSMUST00000176545 356 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
MsraQ9D6Y7 Gm5745-201ENSMUST00000183748 313 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
MsraQ9D6Y7 Zfp930-203ENSMUST00000212312 493 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
MsraQ9D6Y7 AC131187.1-201ENSMUST00000224567 809 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
MsraQ9D6Y7 Alkbh7-201ENSMUST00000002737 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
MsraQ9D6Y7 Pecr-201ENSMUST00000027381 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
MsraQ9D6Y7 Ndufs8-201ENSMUST00000075092 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
MsraQ9D6Y7 Rapgef6-205ENSMUST00000108895 1829 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
MsraQ9D6Y7 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
MsraQ9D6Y7 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
MsraQ9D6Y7 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
MsraQ9D6Y7 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
MsraQ9D6Y7 Hsd17b7-202ENSMUST00000111353 1446 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
MsraQ9D6Y7 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
MsraQ9D6Y7 4933434E20Rik-203ENSMUST00000068798 1500 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
MsraQ9D6Y7 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
MsraQ9D6Y7 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
MsraQ9D6Y7 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
MsraQ9D6Y7 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
MsraQ9D6Y7 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
MsraQ9D6Y7 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
MsraQ9D6Y7 Plekhb1-202ENSMUST00000107043 931 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
MsraQ9D6Y7 Slc7a10-203ENSMUST00000135452 629 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
MsraQ9D6Y7 Zfp511-201ENSMUST00000168194 1076 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
MsraQ9D6Y7 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
MsraQ9D6Y7 Mrpl20-201ENSMUST00000030942 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
MsraQ9D6Y7 Syce1l-201ENSMUST00000034219 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
MsraQ9D6Y7 Syce1l-202ENSMUST00000095173 791 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
MsraQ9D6Y7 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
MsraQ9D6Y7 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
MsraQ9D6Y7 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
MsraQ9D6Y7 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
MsraQ9D6Y7 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
MsraQ9D6Y7 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
MsraQ9D6Y7 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
MsraQ9D6Y7 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
MsraQ9D6Y7 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
MsraQ9D6Y7 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
MsraQ9D6Y7 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
MsraQ9D6Y7 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
MsraQ9D6Y7 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
MsraQ9D6Y7 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
MsraQ9D6Y7 H2-T23-201ENSMUST00000102678 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
MsraQ9D6Y7 Trnt1-203ENSMUST00000113248 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
MsraQ9D6Y7 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
MsraQ9D6Y7 Gm28308-201ENSMUST00000128102 752 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
MsraQ9D6Y7 Haghl-207ENSMUST00000140738 1194 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
MsraQ9D6Y7 Ube2i-208ENSMUST00000173084 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
MsraQ9D6Y7 Sap25-206ENSMUST00000177466 1005 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
MsraQ9D6Y7 Ftl1-ps1-202ENSMUST00000222435 938 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
MsraQ9D6Y7 Smim4-202ENSMUST00000064032 791 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
MsraQ9D6Y7 Gm9898-201ENSMUST00000065469 1161 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
MsraQ9D6Y7 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
MsraQ9D6Y7 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
MsraQ9D6Y7 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
MsraQ9D6Y7 Hmgb3-201ENSMUST00000015361 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
MsraQ9D6Y7 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
MsraQ9D6Y7 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
MsraQ9D6Y7 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
MsraQ9D6Y7 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
MsraQ9D6Y7 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
MsraQ9D6Y7 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
MsraQ9D6Y7 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
MsraQ9D6Y7 Slc39a14-201ENSMUST00000022688 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
MsraQ9D6Y7 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
MsraQ9D6Y7 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
MsraQ9D6Y7 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
MsraQ9D6Y7 Lancl1-203ENSMUST00000119559 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
MsraQ9D6Y7 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
MsraQ9D6Y7 Pcp2-203ENSMUST00000133459 470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
MsraQ9D6Y7 Xrcc2-204ENSMUST00000134972 464 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
MsraQ9D6Y7 Avpi1-201ENSMUST00000018965 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
MsraQ9D6Y7 Snapc2-203ENSMUST00000208316 1190 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
MsraQ9D6Y7 Gm7787-201ENSMUST00000216858 688 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
MsraQ9D6Y7 Pcp2-201ENSMUST00000004749 495 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
MsraQ9D6Y7 Gm11937-201ENSMUST00000076478 396 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
MsraQ9D6Y7 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
MsraQ9D6Y7 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
MsraQ9D6Y7 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
MsraQ9D6Y7 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
MsraQ9D6Y7 6430710C18Rik-203ENSMUST00000136807 1540 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
MsraQ9D6Y7 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
MsraQ9D6Y7 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
MsraQ9D6Y7 Folr1-204ENSMUST00000106985 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
MsraQ9D6Y7 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
MsraQ9D6Y7 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
MsraQ9D6Y7 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
MsraQ9D6Y7 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
MsraQ9D6Y7 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
MsraQ9D6Y7 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
MsraQ9D6Y7 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
MsraQ9D6Y7 Acvr1c-203ENSMUST00000112607 1266 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
MsraQ9D6Y7 Kir3dl1-201ENSMUST00000113104 1031 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
MsraQ9D6Y7 Rhox2d-201ENSMUST00000115179 685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
MsraQ9D6Y7 Slc38a6-204ENSMUST00000126488 589 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.9 ms