Protein–RNA interactions for Protein: Q9D6Y1

Ccdc3, Coiled-coil domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 273 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc3Q9D6Y1 Gm6443-201ENSMUST00000203599 874 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccdc3Q9D6Y1 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccdc3Q9D6Y1 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccdc3Q9D6Y1 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccdc3Q9D6Y1 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccdc3Q9D6Y1 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccdc3Q9D6Y1 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccdc3Q9D6Y1 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccdc3Q9D6Y1 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccdc3Q9D6Y1 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccdc3Q9D6Y1 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccdc3Q9D6Y1 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccdc3Q9D6Y1 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccdc3Q9D6Y1 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccdc3Q9D6Y1 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccdc3Q9D6Y1 Gm13884-201ENSMUST00000118103 829 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccdc3Q9D6Y1 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccdc3Q9D6Y1 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccdc3Q9D6Y1 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccdc3Q9D6Y1 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccdc3Q9D6Y1 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccdc3Q9D6Y1 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccdc3Q9D6Y1 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccdc3Q9D6Y1 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Ccdc3Q9D6Y1 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Ccdc3Q9D6Y1 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccdc3Q9D6Y1 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccdc3Q9D6Y1 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccdc3Q9D6Y1 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccdc3Q9D6Y1 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccdc3Q9D6Y1 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccdc3Q9D6Y1 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccdc3Q9D6Y1 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccdc3Q9D6Y1 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccdc3Q9D6Y1 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccdc3Q9D6Y1 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccdc3Q9D6Y1 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccdc3Q9D6Y1 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccdc3Q9D6Y1 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccdc3Q9D6Y1 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccdc3Q9D6Y1 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccdc3Q9D6Y1 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccdc3Q9D6Y1 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccdc3Q9D6Y1 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc3Q9D6Y1 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc3Q9D6Y1 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc3Q9D6Y1 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc3Q9D6Y1 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc3Q9D6Y1 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc3Q9D6Y1 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc3Q9D6Y1 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc3Q9D6Y1 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc3Q9D6Y1 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc3Q9D6Y1 Nnat-202ENSMUST00000109526 1213 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc3Q9D6Y1 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc3Q9D6Y1 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc3Q9D6Y1 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc3Q9D6Y1 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc3Q9D6Y1 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc3Q9D6Y1 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc3Q9D6Y1 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc3Q9D6Y1 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc3Q9D6Y1 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc3Q9D6Y1 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc3Q9D6Y1 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc3Q9D6Y1 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc3Q9D6Y1 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc3Q9D6Y1 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc3Q9D6Y1 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc3Q9D6Y1 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc3Q9D6Y1 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc3Q9D6Y1 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc3Q9D6Y1 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc3Q9D6Y1 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc3Q9D6Y1 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc3Q9D6Y1 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc3Q9D6Y1 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc3Q9D6Y1 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc3Q9D6Y1 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc3Q9D6Y1 Alas2-201ENSMUST00000066337 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc3Q9D6Y1 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc3Q9D6Y1 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc3Q9D6Y1 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc3Q9D6Y1 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc3Q9D6Y1 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc3Q9D6Y1 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc3Q9D6Y1 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc3Q9D6Y1 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc3Q9D6Y1 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc3Q9D6Y1 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc3Q9D6Y1 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc3Q9D6Y1 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc3Q9D6Y1 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc3Q9D6Y1 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc3Q9D6Y1 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc3Q9D6Y1 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc3Q9D6Y1 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc3Q9D6Y1 Bex1-203ENSMUST00000113120 718 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc3Q9D6Y1 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc3Q9D6Y1 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19 ms