Protein–RNA interactions for Protein: Q9D6J3

Ccdc94, Coiled-coil domain-containing protein 94, mousemouse

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc94Q9D6J3 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ccdc94Q9D6J3 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ccdc94Q9D6J3 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ccdc94Q9D6J3 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ccdc94Q9D6J3 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ccdc94Q9D6J3 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ccdc94Q9D6J3 Smox-208ENSMUST00000110188 1991 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ccdc94Q9D6J3 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ccdc94Q9D6J3 Cspg5-201ENSMUST00000035058 3870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ccdc94Q9D6J3 Timp2-201ENSMUST00000017610 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ccdc94Q9D6J3 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ccdc94Q9D6J3 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ccdc94Q9D6J3 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ccdc94Q9D6J3 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ccdc94Q9D6J3 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ccdc94Q9D6J3 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ccdc94Q9D6J3 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Ccdc94Q9D6J3 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ccdc94Q9D6J3 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ccdc94Q9D6J3 D17Wsu92e-202ENSMUST00000114859 3522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ccdc94Q9D6J3 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ccdc94Q9D6J3 Daxx-201ENSMUST00000079421 2580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ccdc94Q9D6J3 Nrxn1-204ENSMUST00000159778 3414 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ccdc94Q9D6J3 Gm29208-203ENSMUST00000213687 2219 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ccdc94Q9D6J3 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ccdc94Q9D6J3 Dsn1-202ENSMUST00000103130 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ccdc94Q9D6J3 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ccdc94Q9D6J3 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ccdc94Q9D6J3 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Ccdc94Q9D6J3 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ccdc94Q9D6J3 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ccdc94Q9D6J3 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ccdc94Q9D6J3 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ccdc94Q9D6J3 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ccdc94Q9D6J3 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ccdc94Q9D6J3 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ccdc94Q9D6J3 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ccdc94Q9D6J3 Ak1-203ENSMUST00000113278 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ccdc94Q9D6J3 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ccdc94Q9D6J3 Las1l-201ENSMUST00000079987 2530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ccdc94Q9D6J3 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ccdc94Q9D6J3 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ccdc94Q9D6J3 Glis1-202ENSMUST00000106738 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ccdc94Q9D6J3 Sorbs1-208ENSMUST00000224247 2688 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ccdc94Q9D6J3 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ccdc94Q9D6J3 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ccdc94Q9D6J3 Hsph1-209ENSMUST00000202089 3054 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ccdc94Q9D6J3 Fam8a1-201ENSMUST00000099547 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ccdc94Q9D6J3 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Ccdc94Q9D6J3 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Ccdc94Q9D6J3 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ccdc94Q9D6J3 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Ccdc94Q9D6J3 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ccdc94Q9D6J3 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ccdc94Q9D6J3 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ccdc94Q9D6J3 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ccdc94Q9D6J3 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ccdc94Q9D6J3 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ccdc94Q9D6J3 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ccdc94Q9D6J3 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ccdc94Q9D6J3 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ccdc94Q9D6J3 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ccdc94Q9D6J3 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ccdc94Q9D6J3 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ccdc94Q9D6J3 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ccdc94Q9D6J3 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ccdc94Q9D6J3 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ccdc94Q9D6J3 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ccdc94Q9D6J3 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ccdc94Q9D6J3 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ccdc94Q9D6J3 Ccna2-201ENSMUST00000029270 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ccdc94Q9D6J3 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ccdc94Q9D6J3 Spcs2-201ENSMUST00000036274 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ccdc94Q9D6J3 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ccdc94Q9D6J3 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Ccdc94Q9D6J3 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ccdc94Q9D6J3 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ccdc94Q9D6J3 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ccdc94Q9D6J3 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Ccdc94Q9D6J3 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Ccdc94Q9D6J3 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Ccdc94Q9D6J3 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ccdc94Q9D6J3 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ccdc94Q9D6J3 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ccdc94Q9D6J3 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ccdc94Q9D6J3 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ccdc94Q9D6J3 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ccdc94Q9D6J3 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ccdc94Q9D6J3 Slc3a2-202ENSMUST00000170157 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ccdc94Q9D6J3 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ccdc94Q9D6J3 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ccdc94Q9D6J3 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ccdc94Q9D6J3 Wt1-201ENSMUST00000111098 2395 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ccdc94Q9D6J3 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ccdc94Q9D6J3 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ccdc94Q9D6J3 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ccdc94Q9D6J3 Ablim2-205ENSMUST00000114205 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ccdc94Q9D6J3 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ccdc94Q9D6J3 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ccdc94Q9D6J3 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.5 ms