Protein–RNA interactions for Protein: Q9D620

Rab11fip1, Rab11 family-interacting protein 1, mousemouse

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Length 645 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab11fip1Q9D620 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Rab11fip1Q9D620 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Rab11fip1Q9D620 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Rab11fip1Q9D620 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Rab11fip1Q9D620 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Rab11fip1Q9D620 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Rab11fip1Q9D620 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Rab11fip1Q9D620 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Rab11fip1Q9D620 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Rab11fip1Q9D620 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Rab11fip1Q9D620 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Rab11fip1Q9D620 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Rab11fip1Q9D620 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Rab11fip1Q9D620 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Rab11fip1Q9D620 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Rab11fip1Q9D620 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Rab11fip1Q9D620 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Rab11fip1Q9D620 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Rab11fip1Q9D620 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Rab11fip1Q9D620 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Rab11fip1Q9D620 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Rab11fip1Q9D620 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Rab11fip1Q9D620 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Rab11fip1Q9D620 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Rab11fip1Q9D620 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Rab11fip1Q9D620 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Rab11fip1Q9D620 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Rab11fip1Q9D620 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Rab11fip1Q9D620 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Rab11fip1Q9D620 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Rab11fip1Q9D620 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Rab11fip1Q9D620 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Rab11fip1Q9D620 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Rab11fip1Q9D620 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Rab11fip1Q9D620 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Rab11fip1Q9D620 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Rab11fip1Q9D620 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Rab11fip1Q9D620 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Rab11fip1Q9D620 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Rab11fip1Q9D620 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Rab11fip1Q9D620 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Rab11fip1Q9D620 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Rab11fip1Q9D620 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Rab11fip1Q9D620 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Rab11fip1Q9D620 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Rab11fip1Q9D620 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Rab11fip1Q9D620 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Rab11fip1Q9D620 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Rab11fip1Q9D620 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Rab11fip1Q9D620 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Rab11fip1Q9D620 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Rab11fip1Q9D620 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Rab11fip1Q9D620 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Rab11fip1Q9D620 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Rab11fip1Q9D620 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Rab11fip1Q9D620 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Rab11fip1Q9D620 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Rab11fip1Q9D620 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Rab11fip1Q9D620 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Rab11fip1Q9D620 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Rab11fip1Q9D620 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Rab11fip1Q9D620 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rab11fip1Q9D620 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rab11fip1Q9D620 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rab11fip1Q9D620 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rab11fip1Q9D620 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rab11fip1Q9D620 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rab11fip1Q9D620 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rab11fip1Q9D620 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Rab11fip1Q9D620 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rab11fip1Q9D620 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rab11fip1Q9D620 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rab11fip1Q9D620 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rab11fip1Q9D620 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rab11fip1Q9D620 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rab11fip1Q9D620 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rab11fip1Q9D620 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rab11fip1Q9D620 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rab11fip1Q9D620 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rab11fip1Q9D620 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rab11fip1Q9D620 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rab11fip1Q9D620 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rab11fip1Q9D620 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rab11fip1Q9D620 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rab11fip1Q9D620 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rab11fip1Q9D620 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rab11fip1Q9D620 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rab11fip1Q9D620 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rab11fip1Q9D620 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rab11fip1Q9D620 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rab11fip1Q9D620 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rab11fip1Q9D620 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rab11fip1Q9D620 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rab11fip1Q9D620 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rab11fip1Q9D620 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rab11fip1Q9D620 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rab11fip1Q9D620 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rab11fip1Q9D620 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Rab11fip1Q9D620 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rab11fip1Q9D620 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
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