Protein–RNA interactions for Protein: Q9D5Q6

Speer4f1, MCG6381, mousemouse

Predictions only

Length 258 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Speer4f1Q9D5Q6 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Speer4f1Q9D5Q6 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Speer4f1Q9D5Q6 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Speer4f1Q9D5Q6 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Speer4f1Q9D5Q6 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Speer4f1Q9D5Q6 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Speer4f1Q9D5Q6 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Speer4f1Q9D5Q6 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Speer4f1Q9D5Q6 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Speer4f1Q9D5Q6 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Speer4f1Q9D5Q6 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Speer4f1Q9D5Q6 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Speer4f1Q9D5Q6 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Speer4f1Q9D5Q6 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Speer4f1Q9D5Q6 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Speer4f1Q9D5Q6 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Speer4f1Q9D5Q6 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Speer4f1Q9D5Q6 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Speer4f1Q9D5Q6 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Speer4f1Q9D5Q6 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Speer4f1Q9D5Q6 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Speer4f1Q9D5Q6 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Speer4f1Q9D5Q6 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Speer4f1Q9D5Q6 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Speer4f1Q9D5Q6 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Speer4f1Q9D5Q6 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Speer4f1Q9D5Q6 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Speer4f1Q9D5Q6 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Speer4f1Q9D5Q6 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Speer4f1Q9D5Q6 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Speer4f1Q9D5Q6 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Speer4f1Q9D5Q6 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Speer4f1Q9D5Q6 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Speer4f1Q9D5Q6 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Speer4f1Q9D5Q6 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Speer4f1Q9D5Q6 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Speer4f1Q9D5Q6 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Speer4f1Q9D5Q6 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Speer4f1Q9D5Q6 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Speer4f1Q9D5Q6 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Speer4f1Q9D5Q6 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Speer4f1Q9D5Q6 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Speer4f1Q9D5Q6 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Speer4f1Q9D5Q6 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Speer4f1Q9D5Q6 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Speer4f1Q9D5Q6 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Speer4f1Q9D5Q6 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Speer4f1Q9D5Q6 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Speer4f1Q9D5Q6 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Speer4f1Q9D5Q6 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Speer4f1Q9D5Q6 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Speer4f1Q9D5Q6 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Speer4f1Q9D5Q6 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Speer4f1Q9D5Q6 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Speer4f1Q9D5Q6 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Speer4f1Q9D5Q6 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Speer4f1Q9D5Q6 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Speer4f1Q9D5Q6 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Speer4f1Q9D5Q6 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Speer4f1Q9D5Q6 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Speer4f1Q9D5Q6 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Speer4f1Q9D5Q6 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Speer4f1Q9D5Q6 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Speer4f1Q9D5Q6 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Speer4f1Q9D5Q6 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Speer4f1Q9D5Q6 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Speer4f1Q9D5Q6 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Speer4f1Q9D5Q6 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Speer4f1Q9D5Q6 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Speer4f1Q9D5Q6 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Speer4f1Q9D5Q6 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Speer4f1Q9D5Q6 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Speer4f1Q9D5Q6 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Speer4f1Q9D5Q6 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Speer4f1Q9D5Q6 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Speer4f1Q9D5Q6 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Speer4f1Q9D5Q6 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Speer4f1Q9D5Q6 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Speer4f1Q9D5Q6 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Speer4f1Q9D5Q6 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Speer4f1Q9D5Q6 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Speer4f1Q9D5Q6 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Speer4f1Q9D5Q6 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Speer4f1Q9D5Q6 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Speer4f1Q9D5Q6 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Speer4f1Q9D5Q6 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Speer4f1Q9D5Q6 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Speer4f1Q9D5Q6 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Speer4f1Q9D5Q6 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Speer4f1Q9D5Q6 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Speer4f1Q9D5Q6 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Speer4f1Q9D5Q6 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Speer4f1Q9D5Q6 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Speer4f1Q9D5Q6 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Speer4f1Q9D5Q6 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Speer4f1Q9D5Q6 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Speer4f1Q9D5Q6 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Speer4f1Q9D5Q6 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Speer4f1Q9D5Q6 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Speer4f1Q9D5Q6 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 75.3 ms