Protein–RNA interactions for Protein: Q9D548

Zcchc13, Cellular nucleic acid binding protein 2, mousemouse

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Length 170 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zcchc13Q9D548 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Zcchc13Q9D548 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Zcchc13Q9D548 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Zcchc13Q9D548 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Zcchc13Q9D548 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Zcchc13Q9D548 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Zcchc13Q9D548 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Zcchc13Q9D548 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Zcchc13Q9D548 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Zcchc13Q9D548 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Zcchc13Q9D548 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Zcchc13Q9D548 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Zcchc13Q9D548 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Zcchc13Q9D548 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Zcchc13Q9D548 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Zcchc13Q9D548 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Zcchc13Q9D548 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Zcchc13Q9D548 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Zcchc13Q9D548 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Zcchc13Q9D548 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Zcchc13Q9D548 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Zcchc13Q9D548 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Zcchc13Q9D548 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Zcchc13Q9D548 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Zcchc13Q9D548 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Zcchc13Q9D548 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Zcchc13Q9D548 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Zcchc13Q9D548 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Zcchc13Q9D548 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Zcchc13Q9D548 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Zcchc13Q9D548 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Zcchc13Q9D548 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Zcchc13Q9D548 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Zcchc13Q9D548 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Zcchc13Q9D548 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Zcchc13Q9D548 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Zcchc13Q9D548 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Zcchc13Q9D548 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Zcchc13Q9D548 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Zcchc13Q9D548 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Zcchc13Q9D548 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Zcchc13Q9D548 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Zcchc13Q9D548 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Zcchc13Q9D548 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Zcchc13Q9D548 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Zcchc13Q9D548 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Zcchc13Q9D548 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Zcchc13Q9D548 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Zcchc13Q9D548 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Zcchc13Q9D548 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Zcchc13Q9D548 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Zcchc13Q9D548 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Zcchc13Q9D548 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Zcchc13Q9D548 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Zcchc13Q9D548 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Zcchc13Q9D548 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Zcchc13Q9D548 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Zcchc13Q9D548 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Zcchc13Q9D548 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Zcchc13Q9D548 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Zcchc13Q9D548 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Zcchc13Q9D548 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC10.41□□□□□ -0.74
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Zcchc13Q9D548 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Zcchc13Q9D548 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Zcchc13Q9D548 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Zcchc13Q9D548 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Zcchc13Q9D548 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
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Zcchc13Q9D548 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Zcchc13Q9D548 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Zcchc13Q9D548 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Zcchc13Q9D548 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Zcchc13Q9D548 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Zcchc13Q9D548 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Zcchc13Q9D548 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Zcchc13Q9D548 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Zcchc13Q9D548 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Zcchc13Q9D548 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Zcchc13Q9D548 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Zcchc13Q9D548 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Zcchc13Q9D548 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Zcchc13Q9D548 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Zcchc13Q9D548 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Zcchc13Q9D548 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Zcchc13Q9D548 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Zcchc13Q9D548 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Zcchc13Q9D548 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Zcchc13Q9D548 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Zcchc13Q9D548 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Zcchc13Q9D548 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Zcchc13Q9D548 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Zcchc13Q9D548 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Zcchc13Q9D548 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Zcchc13Q9D548 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Zcchc13Q9D548 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
Zcchc13Q9D548 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Zcchc13Q9D548 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Zcchc13Q9D548 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC10.4□□□□□ -0.74
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