Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4J7

Phf6, PHD finger protein 6, mousemouse

Predictions only

Length 364 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Phf6Q9D4J7 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Phf6Q9D4J7 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Phf6Q9D4J7 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Phf6Q9D4J7 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Phf6Q9D4J7 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Phf6Q9D4J7 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Phf6Q9D4J7 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Phf6Q9D4J7 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Phf6Q9D4J7 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Phf6Q9D4J7 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Phf6Q9D4J7 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Phf6Q9D4J7 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Phf6Q9D4J7 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Phf6Q9D4J7 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Phf6Q9D4J7 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Phf6Q9D4J7 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Phf6Q9D4J7 1810062O18Rik-203ENSMUST00000129237 647 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Phf6Q9D4J7 Csrp3-202ENSMUST00000167786 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Phf6Q9D4J7 Hsd3b2-203ENSMUST00000177651 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Phf6Q9D4J7 Gm45144-201ENSMUST00000207473 354 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Phf6Q9D4J7 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Phf6Q9D4J7 Mdk-202ENSMUST00000069423 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Phf6Q9D4J7 Cdkn2d-201ENSMUST00000086374 1264 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Phf6Q9D4J7 Gbp5-201ENSMUST00000090127 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Phf6Q9D4J7 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Phf6Q9D4J7 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Phf6Q9D4J7 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Phf6Q9D4J7 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Phf6Q9D4J7 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Phf6Q9D4J7 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Phf6Q9D4J7 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Phf6Q9D4J7 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Phf6Q9D4J7 4930528D03Rik-201ENSMUST00000181528 1339 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Phf6Q9D4J7 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Phf6Q9D4J7 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Phf6Q9D4J7 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Phf6Q9D4J7 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Phf6Q9D4J7 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Phf6Q9D4J7 Tmem217-201ENSMUST00000114683 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Phf6Q9D4J7 2200002J24Rik-201ENSMUST00000013227 333 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Phf6Q9D4J7 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Phf6Q9D4J7 Fosb-206ENSMUST00000208446 1090 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Phf6Q9D4J7 Gm45231-201ENSMUST00000208629 1064 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Phf6Q9D4J7 AC154222.1-201ENSMUST00000223882 475 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Phf6Q9D4J7 Pfn3-201ENSMUST00000054146 545 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Phf6Q9D4J7 Lce1l-201ENSMUST00000054426 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Phf6Q9D4J7 Hist1h2ak-201ENSMUST00000074752 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Phf6Q9D4J7 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Phf6Q9D4J7 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Phf6Q9D4J7 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Phf6Q9D4J7 Gjb1-203ENSMUST00000119190 1585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Phf6Q9D4J7 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Phf6Q9D4J7 Gm13127-201ENSMUST00000118978 1389 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Phf6Q9D4J7 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Phf6Q9D4J7 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Phf6Q9D4J7 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Phf6Q9D4J7 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Phf6Q9D4J7 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Phf6Q9D4J7 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Phf6Q9D4J7 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Phf6Q9D4J7 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Phf6Q9D4J7 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Phf6Q9D4J7 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Phf6Q9D4J7 Gm13849-201ENSMUST00000153328 835 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Phf6Q9D4J7 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Phf6Q9D4J7 Timm13-201ENSMUST00000020440 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Phf6Q9D4J7 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Phf6Q9D4J7 Elof1-203ENSMUST00000213233 810 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Phf6Q9D4J7 Gm40513-201ENSMUST00000217258 411 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Phf6Q9D4J7 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Phf6Q9D4J7 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Phf6Q9D4J7 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Phf6Q9D4J7 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Phf6Q9D4J7 Rab3a-201ENSMUST00000034301 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Phf6Q9D4J7 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Phf6Q9D4J7 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Phf6Q9D4J7 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Phf6Q9D4J7 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Phf6Q9D4J7 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Phf6Q9D4J7 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Phf6Q9D4J7 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Phf6Q9D4J7 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Phf6Q9D4J7 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Phf6Q9D4J7 Gm11795-201ENSMUST00000127180 396 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Phf6Q9D4J7 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Phf6Q9D4J7 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Phf6Q9D4J7 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Phf6Q9D4J7 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Phf6Q9D4J7 AC090659.1-201ENSMUST00000224334 768 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Phf6Q9D4J7 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Phf6Q9D4J7 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Phf6Q9D4J7 Bhlha9-201ENSMUST00000056184 1207 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Phf6Q9D4J7 Ndufb6-201ENSMUST00000095128 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Phf6Q9D4J7 Olfr632-201ENSMUST00000098189 954 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Phf6Q9D4J7 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Phf6Q9D4J7 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Phf6Q9D4J7 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Phf6Q9D4J7 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Phf6Q9D4J7 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Phf6Q9D4J7 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56 ms