Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4H7

Lonrf3, LON peptidase N-terminal domain and RING finger protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 753 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lonrf3Q9D4H7 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Lonrf3Q9D4H7 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Lonrf3Q9D4H7 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Lonrf3Q9D4H7 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC19■□□□□ 0.63
Lonrf3Q9D4H7 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Lonrf3Q9D4H7 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Lonrf3Q9D4H7 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Lonrf3Q9D4H7 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Lonrf3Q9D4H7 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Lonrf3Q9D4H7 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Lonrf3Q9D4H7 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Lonrf3Q9D4H7 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Lonrf3Q9D4H7 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Lonrf3Q9D4H7 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Lonrf3Q9D4H7 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Lonrf3Q9D4H7 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Lonrf3Q9D4H7 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Lonrf3Q9D4H7 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Lonrf3Q9D4H7 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Lonrf3Q9D4H7 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Lonrf3Q9D4H7 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Lonrf3Q9D4H7 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Lonrf3Q9D4H7 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Lonrf3Q9D4H7 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Lonrf3Q9D4H7 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Lonrf3Q9D4H7 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Lonrf3Q9D4H7 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
Lonrf3Q9D4H7 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Lonrf3Q9D4H7 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
Lonrf3Q9D4H7 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Lonrf3Q9D4H7 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Lonrf3Q9D4H7 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Lonrf3Q9D4H7 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Lonrf3Q9D4H7 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Lonrf3Q9D4H7 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Lonrf3Q9D4H7 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Lonrf3Q9D4H7 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Lonrf3Q9D4H7 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Lonrf3Q9D4H7 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Lonrf3Q9D4H7 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Lonrf3Q9D4H7 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Lonrf3Q9D4H7 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Lonrf3Q9D4H7 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Lonrf3Q9D4H7 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Lonrf3Q9D4H7 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Lonrf3Q9D4H7 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Lonrf3Q9D4H7 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Lonrf3Q9D4H7 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Lonrf3Q9D4H7 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Lonrf3Q9D4H7 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Lonrf3Q9D4H7 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Lonrf3Q9D4H7 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Lonrf3Q9D4H7 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Lonrf3Q9D4H7 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Lonrf3Q9D4H7 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Lonrf3Q9D4H7 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Lonrf3Q9D4H7 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Lonrf3Q9D4H7 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Lonrf3Q9D4H7 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Lonrf3Q9D4H7 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Lonrf3Q9D4H7 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Lonrf3Q9D4H7 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Lonrf3Q9D4H7 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Lonrf3Q9D4H7 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Lonrf3Q9D4H7 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Lonrf3Q9D4H7 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Lonrf3Q9D4H7 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
Lonrf3Q9D4H7 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Lonrf3Q9D4H7 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Lonrf3Q9D4H7 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Lonrf3Q9D4H7 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Lonrf3Q9D4H7 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Lonrf3Q9D4H7 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Lonrf3Q9D4H7 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Lonrf3Q9D4H7 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Lonrf3Q9D4H7 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Lonrf3Q9D4H7 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Lonrf3Q9D4H7 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Lonrf3Q9D4H7 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Lonrf3Q9D4H7 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Lonrf3Q9D4H7 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Lonrf3Q9D4H7 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Lonrf3Q9D4H7 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Lonrf3Q9D4H7 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Lonrf3Q9D4H7 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Lonrf3Q9D4H7 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Lonrf3Q9D4H7 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Lonrf3Q9D4H7 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Lonrf3Q9D4H7 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Lonrf3Q9D4H7 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Lonrf3Q9D4H7 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
Lonrf3Q9D4H7 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Lonrf3Q9D4H7 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Lonrf3Q9D4H7 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Lonrf3Q9D4H7 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Lonrf3Q9D4H7 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Lonrf3Q9D4H7 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Lonrf3Q9D4H7 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Lonrf3Q9D4H7 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Lonrf3Q9D4H7 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.9 ms