Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4E6

Pabpc6, Polyadenylate-binding protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 643 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pabpc6Q9D4E6 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Pabpc6Q9D4E6 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Pabpc6Q9D4E6 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Pabpc6Q9D4E6 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Pabpc6Q9D4E6 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Pabpc6Q9D4E6 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Pabpc6Q9D4E6 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Pabpc6Q9D4E6 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Pabpc6Q9D4E6 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Pabpc6Q9D4E6 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Pabpc6Q9D4E6 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Pabpc6Q9D4E6 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Pabpc6Q9D4E6 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Pabpc6Q9D4E6 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Pabpc6Q9D4E6 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Pabpc6Q9D4E6 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Pabpc6Q9D4E6 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Pabpc6Q9D4E6 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Pabpc6Q9D4E6 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Pabpc6Q9D4E6 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Pabpc6Q9D4E6 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Pabpc6Q9D4E6 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Pabpc6Q9D4E6 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Pabpc6Q9D4E6 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Pabpc6Q9D4E6 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Pabpc6Q9D4E6 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Pabpc6Q9D4E6 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Pabpc6Q9D4E6 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Pabpc6Q9D4E6 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Pabpc6Q9D4E6 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Pabpc6Q9D4E6 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Pabpc6Q9D4E6 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Pabpc6Q9D4E6 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Pabpc6Q9D4E6 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Pabpc6Q9D4E6 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Pabpc6Q9D4E6 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Pabpc6Q9D4E6 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Pabpc6Q9D4E6 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Pabpc6Q9D4E6 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Pabpc6Q9D4E6 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Pabpc6Q9D4E6 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Pabpc6Q9D4E6 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Pabpc6Q9D4E6 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Pabpc6Q9D4E6 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Pabpc6Q9D4E6 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Pabpc6Q9D4E6 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Pabpc6Q9D4E6 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Pabpc6Q9D4E6 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Pabpc6Q9D4E6 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Pabpc6Q9D4E6 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Pabpc6Q9D4E6 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Pabpc6Q9D4E6 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Pabpc6Q9D4E6 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Pabpc6Q9D4E6 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Pabpc6Q9D4E6 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Pabpc6Q9D4E6 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Pabpc6Q9D4E6 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Pabpc6Q9D4E6 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Pabpc6Q9D4E6 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Pabpc6Q9D4E6 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Pabpc6Q9D4E6 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Pabpc6Q9D4E6 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Pabpc6Q9D4E6 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Pabpc6Q9D4E6 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Pabpc6Q9D4E6 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Pabpc6Q9D4E6 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Pabpc6Q9D4E6 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Pabpc6Q9D4E6 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Pabpc6Q9D4E6 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Pabpc6Q9D4E6 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Pabpc6Q9D4E6 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Pabpc6Q9D4E6 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Pabpc6Q9D4E6 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Pabpc6Q9D4E6 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Pabpc6Q9D4E6 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Pabpc6Q9D4E6 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Pabpc6Q9D4E6 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Pabpc6Q9D4E6 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Pabpc6Q9D4E6 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Pabpc6Q9D4E6 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Pabpc6Q9D4E6 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Pabpc6Q9D4E6 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Pabpc6Q9D4E6 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Pabpc6Q9D4E6 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Pabpc6Q9D4E6 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Pabpc6Q9D4E6 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Pabpc6Q9D4E6 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Pabpc6Q9D4E6 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Pabpc6Q9D4E6 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Pabpc6Q9D4E6 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Pabpc6Q9D4E6 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Pabpc6Q9D4E6 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Pabpc6Q9D4E6 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Pabpc6Q9D4E6 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Pabpc6Q9D4E6 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Pabpc6Q9D4E6 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Pabpc6Q9D4E6 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Pabpc6Q9D4E6 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Pabpc6Q9D4E6 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Pabpc6Q9D4E6 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.5 ms