Protein–RNA interactions for Protein: Q9D495

Syce1, Synaptonemal complex central element protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 329 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syce1Q9D495 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Syce1Q9D495 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Syce1Q9D495 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Syce1Q9D495 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Syce1Q9D495 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Syce1Q9D495 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Syce1Q9D495 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Syce1Q9D495 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Syce1Q9D495 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Syce1Q9D495 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Syce1Q9D495 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Syce1Q9D495 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Syce1Q9D495 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Syce1Q9D495 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Syce1Q9D495 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Syce1Q9D495 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Syce1Q9D495 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Syce1Q9D495 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Syce1Q9D495 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Syce1Q9D495 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Syce1Q9D495 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Syce1Q9D495 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Syce1Q9D495 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Syce1Q9D495 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Syce1Q9D495 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Syce1Q9D495 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Syce1Q9D495 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Syce1Q9D495 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Syce1Q9D495 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Syce1Q9D495 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Syce1Q9D495 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Syce1Q9D495 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Syce1Q9D495 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Syce1Q9D495 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Syce1Q9D495 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Syce1Q9D495 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Syce1Q9D495 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Syce1Q9D495 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Syce1Q9D495 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Syce1Q9D495 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Syce1Q9D495 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Syce1Q9D495 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Syce1Q9D495 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Syce1Q9D495 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Syce1Q9D495 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Syce1Q9D495 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Syce1Q9D495 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Syce1Q9D495 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Syce1Q9D495 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Syce1Q9D495 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Syce1Q9D495 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Syce1Q9D495 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Syce1Q9D495 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Syce1Q9D495 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Syce1Q9D495 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Syce1Q9D495 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Syce1Q9D495 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Syce1Q9D495 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Syce1Q9D495 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Syce1Q9D495 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Syce1Q9D495 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Syce1Q9D495 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Syce1Q9D495 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Syce1Q9D495 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Syce1Q9D495 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Syce1Q9D495 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Syce1Q9D495 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Syce1Q9D495 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Syce1Q9D495 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Syce1Q9D495 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Syce1Q9D495 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Syce1Q9D495 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Syce1Q9D495 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Syce1Q9D495 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Syce1Q9D495 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Syce1Q9D495 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Syce1Q9D495 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Syce1Q9D495 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Syce1Q9D495 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Syce1Q9D495 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Syce1Q9D495 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Syce1Q9D495 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Syce1Q9D495 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Syce1Q9D495 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Syce1Q9D495 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Syce1Q9D495 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Syce1Q9D495 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Syce1Q9D495 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Syce1Q9D495 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Syce1Q9D495 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Syce1Q9D495 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Syce1Q9D495 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Syce1Q9D495 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Syce1Q9D495 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Syce1Q9D495 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Syce1Q9D495 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Syce1Q9D495 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Syce1Q9D495 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Syce1Q9D495 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Syce1Q9D495 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.9 ms