Protein–RNA interactions for Protein: Q9D489

Sohlh2, Spermatogenesis- and oogenesis-specific basic helix-loop-helix-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 467 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sohlh2Q9D489 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sohlh2Q9D489 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sohlh2Q9D489 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sohlh2Q9D489 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sohlh2Q9D489 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sohlh2Q9D489 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sohlh2Q9D489 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sohlh2Q9D489 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sohlh2Q9D489 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sohlh2Q9D489 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sohlh2Q9D489 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sohlh2Q9D489 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sohlh2Q9D489 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sohlh2Q9D489 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sohlh2Q9D489 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sohlh2Q9D489 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sohlh2Q9D489 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sohlh2Q9D489 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sohlh2Q9D489 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sohlh2Q9D489 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sohlh2Q9D489 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sohlh2Q9D489 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sohlh2Q9D489 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sohlh2Q9D489 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sohlh2Q9D489 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sohlh2Q9D489 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sohlh2Q9D489 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sohlh2Q9D489 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sohlh2Q9D489 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sohlh2Q9D489 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sohlh2Q9D489 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sohlh2Q9D489 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sohlh2Q9D489 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sohlh2Q9D489 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sohlh2Q9D489 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sohlh2Q9D489 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sohlh2Q9D489 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sohlh2Q9D489 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sohlh2Q9D489 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Sohlh2Q9D489 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Sohlh2Q9D489 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sohlh2Q9D489 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sohlh2Q9D489 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sohlh2Q9D489 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Sohlh2Q9D489 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sohlh2Q9D489 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sohlh2Q9D489 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sohlh2Q9D489 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sohlh2Q9D489 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sohlh2Q9D489 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sohlh2Q9D489 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sohlh2Q9D489 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sohlh2Q9D489 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sohlh2Q9D489 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sohlh2Q9D489 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sohlh2Q9D489 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sohlh2Q9D489 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Sohlh2Q9D489 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sohlh2Q9D489 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sohlh2Q9D489 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sohlh2Q9D489 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sohlh2Q9D489 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sohlh2Q9D489 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sohlh2Q9D489 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sohlh2Q9D489 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sohlh2Q9D489 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sohlh2Q9D489 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sohlh2Q9D489 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sohlh2Q9D489 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sohlh2Q9D489 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sohlh2Q9D489 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sohlh2Q9D489 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sohlh2Q9D489 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sohlh2Q9D489 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sohlh2Q9D489 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sohlh2Q9D489 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sohlh2Q9D489 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Sohlh2Q9D489 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sohlh2Q9D489 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sohlh2Q9D489 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sohlh2Q9D489 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sohlh2Q9D489 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sohlh2Q9D489 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sohlh2Q9D489 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Sohlh2Q9D489 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Sohlh2Q9D489 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sohlh2Q9D489 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Sohlh2Q9D489 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sohlh2Q9D489 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sohlh2Q9D489 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sohlh2Q9D489 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sohlh2Q9D489 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sohlh2Q9D489 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sohlh2Q9D489 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sohlh2Q9D489 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sohlh2Q9D489 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sohlh2Q9D489 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sohlh2Q9D489 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sohlh2Q9D489 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Sohlh2Q9D489 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.6 ms