Protein–RNA interactions for Protein: Q9D3X3

4933428M09Rik, RIKEN cDNA 4933428M09 gene, mousemouse

Predictions only

Length 192 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4933428M09RikQ9D3X3 Fam84b-201ENSMUST00000100635 5565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
4933428M09RikQ9D3X3 Arhgef40-204ENSMUST00000182061 4756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
4933428M09RikQ9D3X3 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
4933428M09RikQ9D3X3 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
4933428M09RikQ9D3X3 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
4933428M09RikQ9D3X3 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
4933428M09RikQ9D3X3 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
4933428M09RikQ9D3X3 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
4933428M09RikQ9D3X3 Slc52a3-203ENSMUST00000109859 2204 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
4933428M09RikQ9D3X3 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
4933428M09RikQ9D3X3 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
4933428M09RikQ9D3X3 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
4933428M09RikQ9D3X3 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
4933428M09RikQ9D3X3 Dmxl1-202ENSMUST00000180611 11319 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
4933428M09RikQ9D3X3 Phc2-201ENSMUST00000030588 3949 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
4933428M09RikQ9D3X3 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
4933428M09RikQ9D3X3 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
4933428M09RikQ9D3X3 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
4933428M09RikQ9D3X3 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
4933428M09RikQ9D3X3 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
4933428M09RikQ9D3X3 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
4933428M09RikQ9D3X3 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
4933428M09RikQ9D3X3 3110082I17Rik-204ENSMUST00000198474 2030 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
4933428M09RikQ9D3X3 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
4933428M09RikQ9D3X3 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
4933428M09RikQ9D3X3 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
4933428M09RikQ9D3X3 Gm28496-202ENSMUST00000137742 2752 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
4933428M09RikQ9D3X3 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
4933428M09RikQ9D3X3 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
4933428M09RikQ9D3X3 Cryzl1-201ENSMUST00000073466 1965 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
4933428M09RikQ9D3X3 Maged2-201ENSMUST00000026302 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
4933428M09RikQ9D3X3 Map4k5-202ENSMUST00000110567 4250 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
4933428M09RikQ9D3X3 Tdrd7-201ENSMUST00000102929 3716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
4933428M09RikQ9D3X3 Gata4-202ENSMUST00000118022 3374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
4933428M09RikQ9D3X3 Gm5934-201ENSMUST00000120734 2588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
4933428M09RikQ9D3X3 Btd-201ENSMUST00000090147 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
4933428M09RikQ9D3X3 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
4933428M09RikQ9D3X3 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
4933428M09RikQ9D3X3 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
4933428M09RikQ9D3X3 Tpr-201ENSMUST00000119161 7480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
4933428M09RikQ9D3X3 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
4933428M09RikQ9D3X3 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
4933428M09RikQ9D3X3 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
4933428M09RikQ9D3X3 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
4933428M09RikQ9D3X3 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
4933428M09RikQ9D3X3 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
4933428M09RikQ9D3X3 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
4933428M09RikQ9D3X3 Scarf1-202ENSMUST00000118243 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
4933428M09RikQ9D3X3 Siglecf-203ENSMUST00000122423 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
4933428M09RikQ9D3X3 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
4933428M09RikQ9D3X3 Myo1c-204ENSMUST00000108431 4718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
4933428M09RikQ9D3X3 Cybrd1-201ENSMUST00000028403 5339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
4933428M09RikQ9D3X3 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
4933428M09RikQ9D3X3 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
4933428M09RikQ9D3X3 Pcdha11-202ENSMUST00000115657 5360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
4933428M09RikQ9D3X3 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
4933428M09RikQ9D3X3 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
4933428M09RikQ9D3X3 Elmsan1-202ENSMUST00000110294 7156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
4933428M09RikQ9D3X3 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
4933428M09RikQ9D3X3 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
4933428M09RikQ9D3X3 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC16■□□□□ 0.15
4933428M09RikQ9D3X3 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
4933428M09RikQ9D3X3 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
4933428M09RikQ9D3X3 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
4933428M09RikQ9D3X3 Kcnh1-202ENSMUST00000110844 7161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
4933428M09RikQ9D3X3 D17Wsu92e-202ENSMUST00000114859 3522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
4933428M09RikQ9D3X3 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
4933428M09RikQ9D3X3 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
4933428M09RikQ9D3X3 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
4933428M09RikQ9D3X3 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
4933428M09RikQ9D3X3 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC16■□□□□ 0.15
4933428M09RikQ9D3X3 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
4933428M09RikQ9D3X3 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
4933428M09RikQ9D3X3 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
4933428M09RikQ9D3X3 Tgfbr3-201ENSMUST00000031224 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
4933428M09RikQ9D3X3 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
4933428M09RikQ9D3X3 Ncs1-201ENSMUST00000000199 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
4933428M09RikQ9D3X3 Wt1-201ENSMUST00000111098 2395 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
4933428M09RikQ9D3X3 Klf15-202ENSMUST00000113530 2374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
4933428M09RikQ9D3X3 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
4933428M09RikQ9D3X3 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
4933428M09RikQ9D3X3 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
4933428M09RikQ9D3X3 Kcnq2-220ENSMUST00000197015 8031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
4933428M09RikQ9D3X3 Llgl1-201ENSMUST00000052346 4303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
4933428M09RikQ9D3X3 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
4933428M09RikQ9D3X3 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
4933428M09RikQ9D3X3 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
4933428M09RikQ9D3X3 A330035P11Rik-202ENSMUST00000144926 3074 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
4933428M09RikQ9D3X3 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
4933428M09RikQ9D3X3 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
4933428M09RikQ9D3X3 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
4933428M09RikQ9D3X3 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
4933428M09RikQ9D3X3 Sorbs1-208ENSMUST00000224247 2688 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
4933428M09RikQ9D3X3 Stk40-202ENSMUST00000116286 3860 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
4933428M09RikQ9D3X3 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
4933428M09RikQ9D3X3 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
4933428M09RikQ9D3X3 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
4933428M09RikQ9D3X3 Stard5-201ENSMUST00000075418 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
4933428M09RikQ9D3X3 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
4933428M09RikQ9D3X3 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.5 ms