Protein–RNA interactions for Protein: Q9D3W5

Lrrc71, Leucine-rich repeat-containing protein 71, mousemouse

Predictions only

Length 558 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrc71Q9D3W5 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Lrrc71Q9D3W5 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
Lrrc71Q9D3W5 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Lrrc71Q9D3W5 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Lrrc71Q9D3W5 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Lrrc71Q9D3W5 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Lrrc71Q9D3W5 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Lrrc71Q9D3W5 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Lrrc71Q9D3W5 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
Lrrc71Q9D3W5 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Lrrc71Q9D3W5 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Lrrc71Q9D3W5 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Lrrc71Q9D3W5 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Lrrc71Q9D3W5 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Lrrc71Q9D3W5 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Lrrc71Q9D3W5 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Lrrc71Q9D3W5 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Lrrc71Q9D3W5 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Lrrc71Q9D3W5 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Lrrc71Q9D3W5 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.38
Lrrc71Q9D3W5 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.38
Lrrc71Q9D3W5 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Lrrc71Q9D3W5 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Lrrc71Q9D3W5 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Lrrc71Q9D3W5 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Lrrc71Q9D3W5 Slc19a2-204ENSMUST00000169394 894 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Lrrc71Q9D3W5 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Lrrc71Q9D3W5 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Lrrc71Q9D3W5 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Lrrc71Q9D3W5 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Lrrc71Q9D3W5 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Lrrc71Q9D3W5 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
Lrrc71Q9D3W5 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
Lrrc71Q9D3W5 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Lrrc71Q9D3W5 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Lrrc71Q9D3W5 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Lrrc71Q9D3W5 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Lrrc71Q9D3W5 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Lrrc71Q9D3W5 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Lrrc71Q9D3W5 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Lrrc71Q9D3W5 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Lrrc71Q9D3W5 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Lrrc71Q9D3W5 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Lrrc71Q9D3W5 Gm44454-201ENSMUST00000198541 138 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Lrrc71Q9D3W5 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Lrrc71Q9D3W5 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Lrrc71Q9D3W5 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Lrrc71Q9D3W5 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Lrrc71Q9D3W5 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Lrrc71Q9D3W5 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Lrrc71Q9D3W5 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Lrrc71Q9D3W5 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Lrrc71Q9D3W5 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Lrrc71Q9D3W5 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Lrrc71Q9D3W5 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Lrrc71Q9D3W5 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Lrrc71Q9D3W5 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Lrrc71Q9D3W5 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Lrrc71Q9D3W5 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Lrrc71Q9D3W5 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Lrrc71Q9D3W5 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Lrrc71Q9D3W5 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Lrrc71Q9D3W5 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Lrrc71Q9D3W5 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Lrrc71Q9D3W5 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Lrrc71Q9D3W5 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Lrrc71Q9D3W5 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Lrrc71Q9D3W5 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Lrrc71Q9D3W5 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Lrrc71Q9D3W5 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Lrrc71Q9D3W5 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Lrrc71Q9D3W5 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Lrrc71Q9D3W5 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Lrrc71Q9D3W5 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Lrrc71Q9D3W5 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Lrrc71Q9D3W5 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Lrrc71Q9D3W5 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Lrrc71Q9D3W5 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Lrrc71Q9D3W5 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Lrrc71Q9D3W5 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Lrrc71Q9D3W5 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Lrrc71Q9D3W5 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Lrrc71Q9D3W5 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Lrrc71Q9D3W5 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Lrrc71Q9D3W5 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Lrrc71Q9D3W5 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Lrrc71Q9D3W5 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Lrrc71Q9D3W5 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Lrrc71Q9D3W5 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Lrrc71Q9D3W5 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Lrrc71Q9D3W5 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Lrrc71Q9D3W5 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Lrrc71Q9D3W5 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Lrrc71Q9D3W5 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Lrrc71Q9D3W5 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Lrrc71Q9D3W5 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Lrrc71Q9D3W5 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Lrrc71Q9D3W5 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Lrrc71Q9D3W5 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Lrrc71Q9D3W5 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 101.7 ms